56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1765 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  100 
 
 		 819 aa  1612    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  34.61 
 
 		 781 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  34.49 
 
 		 837 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  35.14 
 
 		 856 aa  372  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  30.24 
 
 		 822 aa  355  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  29.18 
 
 		 802 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  34.07 
 
 		 809 aa  336  1e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  30.58 
 
 		 841 aa  331  4e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  30.13 
 
 		 825 aa  328  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  29.76 
 
 		 786 aa  327  8.000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  30.79 
 
 		 833 aa  326  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  31.23 
 
 		 868 aa  321  3e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 824 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  28.69 
 
 		 825 aa  296  9e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  39.75 
 
 		 646 aa  296  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  30.88 
 
 		 762 aa  291  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.79 
 
 		 784 aa  286  9e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  29.9 
 
 		 741 aa  283  9e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  28.77 
 
 		 768 aa  282  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  28.5 
 
 		 811 aa  281  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  43.35 
 
 		 808 aa  281  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  29.67 
 
 		 842 aa  279  2e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  26.87 
 
 		 864 aa  278  4e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  35.71 
 
 		 816 aa  276  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.45 
 
 		 1094 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  33.53 
 
 		 759 aa  267  5e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  27.59 
 
 		 781 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  28.62 
 
 		 747 aa  259  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 757 aa  253  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  27.99 
 
 		 790 aa  251  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  28.14 
 
 		 760 aa  251  4e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  26.03 
 
 		 758 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  35.96 
 
 		 1139 aa  247  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  26.35 
 
 		 1164 aa  244  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  25.87 
 
 		 778 aa  240  9e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  31.34 
 
 		 940 aa  237  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  28.41 
 
 		 991 aa  233  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  35.68 
 
 		 835 aa  227  8e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  25.8 
 
 		 1193 aa  217  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  27.36 
 
 		 803 aa  216  9e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  26.28 
 
 		 1479 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  24.72 
 
 		 788 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  31.48 
 
 		 742 aa  183  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  33.02 
 
 		 831 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  27.64 
 
 		 796 aa  174  5e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  30.31 
 
 		 809 aa  159  2e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  29.78 
 
 		 943 aa  156  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  30.57 
 
 		 804 aa  150  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  29.5 
 
 		 773 aa  142  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.98 
 
 		 809 aa  104  7e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  28.02 
 
 		 757 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  29.07 
 
 		 753 aa  97.1  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  23.46 
 
 		 770 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  40.66 
 
 		 116 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  30 
 
 		 262 aa  51.6  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  27.27 
 
 		 928 aa  49.3  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0237915 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>