56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0186 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  100 
 
 
788 aa  1643    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  30.7 
 
 
778 aa  345  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 
781 aa  343  5e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  30.94 
 
 
759 aa  340  5e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  30.15 
 
 
816 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  30.9 
 
 
842 aa  339  9.999999999999999e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  29.27 
 
 
822 aa  334  3e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  29.54 
 
 
768 aa  324  4e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  28.44 
 
 
758 aa  323  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  28.97 
 
 
825 aa  320  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  30.18 
 
 
833 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  29.64 
 
 
825 aa  318  3e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  31.45 
 
 
841 aa  317  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  29.75 
 
 
790 aa  317  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  31.04 
 
 
741 aa  315  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.28 
 
 
1094 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  30.62 
 
 
1139 aa  313  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  30.12 
 
 
835 aa  312  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  31.13 
 
 
811 aa  312  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.89 
 
 
784 aa  306  7e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  28.98 
 
 
868 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  27.37 
 
 
802 aa  304  3.0000000000000004e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 
757 aa  304  5.000000000000001e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  29.87 
 
 
786 aa  303  8.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  30.08 
 
 
747 aa  300  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  27.92 
 
 
760 aa  295  3e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  28.46 
 
 
864 aa  291  3e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  29.91 
 
 
1164 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  30.62 
 
 
809 aa  287  5.999999999999999e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  30.78 
 
 
1193 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  31.44 
 
 
831 aa  282  2e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  30.48 
 
 
781 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  29.21 
 
 
1479 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  28.86 
 
 
796 aa  278  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  29.1 
 
 
856 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  28.93 
 
 
803 aa  265  3e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  29.61 
 
 
824 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  29.31 
 
 
742 aa  254  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  34.92 
 
 
646 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  28.53 
 
 
991 aa  249  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  35.04 
 
 
837 aa  245  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  28.37 
 
 
940 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  26.89 
 
 
762 aa  232  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  28.76 
 
 
773 aa  227  6e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  25.42 
 
 
809 aa  193  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  29.98 
 
 
819 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  31.11 
 
 
808 aa  186  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  26.1 
 
 
943 aa  182  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  23.72 
 
 
804 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  25.71 
 
 
809 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  24.06 
 
 
753 aa  112  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  25.6 
 
 
757 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  25.17 
 
 
770 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  23.22 
 
 
750 aa  77  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  28.49 
 
 
262 aa  73.9  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  36.61 
 
 
116 aa  61.6  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>