58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1120 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1120  hypothetical protein  100 
 
 
796 aa  1648    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28510  hypothetical protein  41.07 
 
 
773 aa  532  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2129  fibronectin type III domain-containing protein  38.82 
 
 
1479 aa  508  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  39.09 
 
 
1193 aa  501  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1435  hypothetical protein  36.65 
 
 
790 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.931563  normal  0.0505935 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2503  hypothetical protein  36.84 
 
 
803 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.20212  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8217  Alpha-L-fucosidase  37.24 
 
 
991 aa  454  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5237  alpha-L-fucosidase, putative, afc95A  37.61 
 
 
742 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139912  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4083  hypothetical protein  33.78 
 
 
816 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1856  glycoside hydrolase family protein  35.75 
 
 
781 aa  423  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2699  Alpha-L-fucosidase  34.14 
 
 
825 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000179914  normal  0.370363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4283  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.96 
 
 
1094 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6800  Alpha-L-fucosidase  34.34 
 
 
778 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000092205  unclonable  0.0000000000000164312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2698  Alpha-L-fucosidase  33.25 
 
 
868 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.447699  normal  0.17136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1878  Alpha-L-fucosidase  34.08 
 
 
825 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1020  hypothetical protein  36.36 
 
 
759 aa  406  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1256  hypothetical protein  34.84 
 
 
768 aa  405  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.471083  normal  0.43863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0813  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 
786 aa  398  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7192  Alpha-L-fucosidase  34.08 
 
 
811 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000769318  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1484  Alpha-L-fucosidase  33.21 
 
 
842 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5006  Alpha-L-fucosidase  31.07 
 
 
864 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.9086 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3112  hypothetical protein  32.28 
 
 
822 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.31763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1752  hypothetical protein  34.71 
 
 
833 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187912  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5141  hypothetical protein  33.64 
 
 
741 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0772  hypothetical protein  31.57 
 
 
802 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2817  Alpha-L-fucosidase  35.76 
 
 
940 aa  386  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2700  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.16 
 
 
784 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5543  Alpha-L-fucosidase  34.43 
 
 
841 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0324078  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5679  Alpha-L-fucosidase  32.76 
 
 
747 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.357027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  31.18 
 
 
1139 aa  362  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3803  Ricin B lectin  33.66 
 
 
943 aa  360  6e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307116  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10376  conserved hypothetical protein  31.57 
 
 
757 aa  348  3e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2555  hypothetical protein  31.82 
 
 
804 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194451  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0874  hypothetical protein  30.43 
 
 
760 aa  342  1e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.272656  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0071  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 
835 aa  342  2e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  30.65 
 
 
1164 aa  334  4e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1395  hypothetical protein  30.52 
 
 
758 aa  333  6e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00458705  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2411  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 
824 aa  322  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06673  alpha-fucosidase (Eurofung)  29.56 
 
 
831 aa  293  1e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00444703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3002  Alpha-L-fucosidase  27.86 
 
 
809 aa  284  6.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0186  glycoside hydrolase family 95  29.13 
 
 
788 aa  282  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.771982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0429  twin-arginine translocation pathway signal  29.62 
 
 
781 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.767202 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08149  Alpha-fucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AU81]  29.34 
 
 
809 aa  270  8.999999999999999e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.954517 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05400  hypothetical protein  28.76 
 
 
856 aa  270  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1192  hypothetical protein  32.88 
 
 
837 aa  258  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2174  hypothetical protein  34.03 
 
 
646 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.007459  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29100  hypothetical protein  28.7 
 
 
762 aa  232  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.142141  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4191  twin-arginine translocation pathway signal  26.4 
 
 
808 aa  197  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.411949  normal  0.364475 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1765  hypothetical protein  27.33 
 
 
819 aa  172  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00969873  normal  0.0262945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0084  hypothetical protein  23.91 
 
 
809 aa  152  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1563  hypothetical protein  23.1 
 
 
770 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.156768  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1614  hypothetical protein  22.66 
 
 
753 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.126205  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5561  Alpha-L-fucosidase  25.42 
 
 
757 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.56822 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1707  hypothetical protein  21.44 
 
 
750 aa  83.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.358373  normal  0.023809 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3110  hypothetical protein  22.22 
 
 
928 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0237915 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00114  expressed protein  28.42 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00113  hypothetical protein  38.68 
 
 
116 aa  75.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.688258  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2707  Trehalose and maltose hydrolase (possible phosphorylase)  22.56 
 
 
765 aa  48.9  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0712554  normal  0.489106 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>