31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2171 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  100 
 
 		 1879 aa  3799    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.75 
 
 		 1454 aa  130  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  27.15 
 
 		 545 aa  89.4  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  27.27 
 
 		 2030 aa  88.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  39.68 
 
 		 979 aa  87.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  24.42 
 
 		 1619 aa  83.2  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44 
 
 		 1323 aa  78.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  22.49 
 
 		 926 aa  77.8  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  24.93 
 
 		 6109 aa  74.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  43.68 
 
 		 1310 aa  70.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  26.12 
 
 		 631 aa  70.1  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2723  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.13 
 
 		 552 aa  69.7  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547831  normal  0.0221435 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  27.24 
 
 		 953 aa  62.4  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.59 
 
 		 627 aa  60.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  26.43 
 
 		 405 aa  58.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2889  protein of unknown function DUF291  44.83 
 
 		 1672 aa  56.6  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.74 
 
 		 1001 aa  56.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  37.96 
 
 		 702 aa  54.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  34.69 
 
 		 746 aa  54.7  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  24.55 
 
 		 1613 aa  52.4  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  38.89 
 
 		 692 aa  51.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2184  hypothetical protein  35.71 
 
 		 713 aa  50.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2325  APHP  25.32 
 
 		 290 aa  49.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1657 aa  47.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.66 
 
 		 1212 aa  46.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0899  hypothetical protein  23.34 
 
 		 557 aa  46.6  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00051112  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  26.71 
 
 		 2169 aa  46.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3161  lipase, class 2  29.25 
 
 		 281 aa  45.8  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0217102 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  30.13 
 
 		 1193 aa  45.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  23.87 
 
 		 1748 aa  45.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  22.78 
 
 		 1091 aa  45.4  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>