31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1252 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1252  peptidase C11 clostripain  100 
 
 		 979 aa  1994    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.016836  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0286  peptidase C11, clostripain  39.25 
 
 		 488 aa  299  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2154  peptidase C11 clostripain  31.79 
 
 		 766 aa  164  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.372371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1520  FHA domain-containing protein  27.95 
 
 		 1065 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00810345  decreased coverage  0.000340593 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2277  peptidase C11 clostripain  25.43 
 
 		 914 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000811314  hitchhiker  0.0000000350123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2035  peptidase C11, clostripain  25 
 
 		 1157 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.762463  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1209  hypothetical protein  24.65 
 
 		 429 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00911503  normal  0.0218928 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  30.74 
 
 		 815 aa  103  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  25.18 
 
 		 1011 aa  96.3  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  33.47 
 
 		 1224 aa  94.4  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1281  peptidase C11, clostripain  25.32 
 
 		 657 aa  88.6  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2171  hypothetical protein  39.68 
 
 		 1879 aa  87.4  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0421  peptidase C11 clostripain  26.3 
 
 		 310 aa  84.3  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5817  peptidase C11 clostripain  23.13 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2074  clostripain  28.03 
 
 		 630 aa  77.8  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0840  alpha-clostripain  26.45 
 
 		 522 aa  70.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.832986  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0833  alpha-clostripain  25.94 
 
 		 522 aa  70.1  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00458898  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2805  clostripain  26.2 
 
 		 640 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.624976 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2076  hypothetical protein  28.95 
 
 		 623 aa  69.3  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.534592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4453  hypothetical protein  26.15 
 
 		 624 aa  67  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0349  hypothetical protein  36.54 
 
 		 399 aa  65.1  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.286658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1815  peptidase C11 clostripain  23.11 
 
 		 748 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00011349  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1657 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1868  hypothetical protein  27.94 
 
 		 431 aa  64.3  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000489897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  45.83 
 
 		 692 aa  61.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0249  peptidase C11, clostripain  27.03 
 
 		 802 aa  57.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0601306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2806  clostripain  26.83 
 
 		 359 aa  54.7  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.35662 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1476  hypothetical protein  24.47 
 
 		 679 aa  53.5  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00481872  decreased coverage  0.000172669 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2184  hypothetical protein  36 
 
 		 713 aa  48.5  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3993  hypothetical protein  24.23 
 
 		 872 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4627  serine protease  31.01 
 
 		 702 aa  44.7  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>