24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2544 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2544  APHP domain protein  100 
 
 		 405 aa  767    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2325  YD repeat-containing protein  43.95 
 
 		 6109 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0257646 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  41.71 
 
 		 1613 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  39.63 
 
 		 1748 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  39.34 
 
 		 2030 aa  176  4e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.37 
 
 		 1454 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.37 
 
 		 953 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000882401  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0498  APHP  31.3 
 
 		 545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0698574  normal  0.525428 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2450  APHP  35.77 
 
 		 1619 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.804574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1936  APHP domain protein  30.6 
 
 		 1074 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620471  normal  0.229187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1893  peptidase-like  31.51 
 
 		 2632 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 		 627 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3989  hypothetical protein  28.29 
 
 		 2528 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 1726 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1743  hypothetical protein  32.35 
 
 		 926 aa  60.1  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.274233  normal  0.78184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2325  APHP  27.36 
 
 		 290 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0899  hypothetical protein  27.34 
 
 		 557 aa  55.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00051112  normal  0.102031 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.77 
 
 		 1091 aa  54.3  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35 
 
 		 606 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04725  Subtilase family protein  30.5 
 
 		 145 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.808731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2289  hypothetical protein  28.7 
 
 		 620 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.68 
 
 		 6885 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1462  APHP domain protein  32.91 
 
 		 1378 aa  43.5  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>