39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1446 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1446  fibronectin, type III domain-containing protein  100 
 
 
1089 aa  2225    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  26.42 
 
 
1067 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  27.62 
 
 
1057 aa  59.3  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  31.44 
 
 
1462 aa  58.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  28.12 
 
 
1221 aa  57.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  29.02 
 
 
455 aa  55.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  34.18 
 
 
456 aa  55.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29 
 
 
455 aa  55.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  29.02 
 
 
455 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  28.7 
 
 
455 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  29.41 
 
 
1061 aa  53.5  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.7 
 
 
455 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  28.02 
 
 
1050 aa  52.8  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  35.42 
 
 
456 aa  52.4  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  28.26 
 
 
455 aa  51.6  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  28.26 
 
 
455 aa  51.6  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  26.37 
 
 
1194 aa  51.6  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3674  Fibronectin type III domain protein  26.81 
 
 
484 aa  51.2  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.457522  hitchhiker  0.000917339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  28.57 
 
 
455 aa  50.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  28.99 
 
 
3238 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  29 
 
 
455 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  32 
 
 
455 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  32 
 
 
455 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  31.67 
 
 
741 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  26.15 
 
 
1887 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4484  hypothetical protein  32.04 
 
 
1372 aa  49.3  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.517652  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  28.65 
 
 
1004 aa  48.9  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  32 
 
 
970 aa  47.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1817  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.85 
 
 
1787 aa  47  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.29404 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  30.06 
 
 
448 aa  46.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  26.79 
 
 
768 aa  46.2  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0064  hypothetical protein  25.41 
 
 
763 aa  45.8  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.1 
 
 
809 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  27.89 
 
 
1051 aa  45.8  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.14 
 
 
458 aa  45.8  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.67 
 
 
9585 aa  45.8  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2392  Fibronectin type III domain protein  32.26 
 
 
831 aa  45.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  27.31 
 
 
458 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  31.82 
 
 
481 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>