58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0600 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  55.46 
 
 		 837 aa  864    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.08 
 
 		 777 aa  792    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.82 
 
 		 858 aa  862    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.31 
 
 		 840 aa  857    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.82 
 
 		 858 aa  862    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.46 
 
 		 858 aa  855    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  53.51 
 
 		 808 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.17 
 
 		 833 aa  880    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  54.08 
 
 		 817 aa  804    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  55.92 
 
 		 820 aa  859    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.27 
 
 		 838 aa  845    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.14 
 
 		 838 aa  858    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 803 aa  1653    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  53.69 
 
 		 847 aa  838    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  53.51 
 
 		 808 aa  814    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  53.5 
 
 		 860 aa  811    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  56.23 
 
 		 841 aa  875    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  55.97 
 
 		 821 aa  868    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  59.16 
 
 		 433 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.12 
 
 		 715 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  48.91 
 
 		 430 aa  325  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.12 
 
 		 692 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.12 
 
 		 681 aa  322  1.9999999999999998e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.12 
 
 		 814 aa  319  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.79 
 
 		 802 aa  310  8e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.39 
 
 		 801 aa  309  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.79 
 
 		 803 aa  309  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.6 
 
 		 1160 aa  285  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.94 
 
 		 800 aa  283  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.31 
 
 		 882 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  30.19 
 
 		 882 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  29.55 
 
 		 881 aa  272  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  30.16 
 
 		 881 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  30.33 
 
 		 1592 aa  256  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.46 
 
 		 1505 aa  253  9.000000000000001e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.28 
 
 		 761 aa  252  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  27.68 
 
 		 835 aa  232  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.13 
 
 		 798 aa  228  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.16 
 
 		 786 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  28.16 
 
 		 786 aa  224  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.53 
 
 		 1132 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  28.16 
 
 		 615 aa  68.9  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.36 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  23.58 
 
 		 668 aa  63.5  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  22.56 
 
 		 647 aa  63.5  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  26.72 
 
 		 670 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  24.26 
 
 		 649 aa  58.2  0.0000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  27.41 
 
 		 621 aa  56.6  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  24.46 
 
 		 621 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  24.17 
 
 		 621 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  24.23 
 
 		 621 aa  52.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  23.44 
 
 		 663 aa  51.6  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.22 
 
 		 569 aa  51.6  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  25.74 
 
 		 604 aa  51.2  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  24.71 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  24.84 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  21.35 
 
 		 673 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  22.34 
 
 		 615 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>