58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7156 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 
1132 aa  2265    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.1 
 
 
715 aa  382  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  36.35 
 
 
1160 aa  354  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.04 
 
 
1505 aa  293  2e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  30.43 
 
 
881 aa  290  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.41 
 
 
814 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.61 
 
 
882 aa  272  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  30.61 
 
 
881 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.78 
 
 
803 aa  271  5e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  30.61 
 
 
882 aa  271  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.22 
 
 
681 aa  270  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.78 
 
 
802 aa  270  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.22 
 
 
692 aa  269  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.67 
 
 
801 aa  256  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.95 
 
 
858 aa  254  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.96 
 
 
800 aa  252  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.93 
 
 
858 aa  250  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.93 
 
 
858 aa  250  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.98 
 
 
820 aa  245  3.9999999999999997e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  28.48 
 
 
847 aa  241  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.55 
 
 
817 aa  240  9e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.14 
 
 
837 aa  240  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.47 
 
 
838 aa  239  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  27.56 
 
 
1592 aa  237  9e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.11 
 
 
840 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  28.76 
 
 
835 aa  229  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.84 
 
 
761 aa  225  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.35 
 
 
838 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.06 
 
 
833 aa  218  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.85 
 
 
841 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.4 
 
 
860 aa  215  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.59 
 
 
808 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.59 
 
 
808 aa  214  7e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.46 
 
 
786 aa  209  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.29 
 
 
821 aa  209  3e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  28.46 
 
 
786 aa  209  3e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.92 
 
 
777 aa  190  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.26 
 
 
798 aa  184  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.59 
 
 
803 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.13 
 
 
433 aa  161  5e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  27.84 
 
 
430 aa  77  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1460  Protein of unknown function DUF2223  27.43 
 
 
1255 aa  72.8  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0675  glycoside hydrolase family 57  24.35 
 
 
1042 aa  57.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1616  glycoside hydrolase family protein  23.51 
 
 
1006 aa  57.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16030  Membrane-anchored protein predicted to be involved in regulation of amylopullulanase  29.2 
 
 
313 aa  56.6  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4286  membrane-anchored protein  33.66 
 
 
267 aa  55.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1866  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 
1000 aa  55.1  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4264  membrane-anchored protein  33.66 
 
 
267 aa  55.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0676  pullulanase  25.75 
 
 
267 aa  54.3  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4133  membrane-anchored protein  33.66 
 
 
267 aa  53.5  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  23.29 
 
 
668 aa  51.6  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 
663 aa  50.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  22.69 
 
 
647 aa  49.7  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1616  glycoside hydrolase family 13 protein  22.73 
 
 
663 aa  48.9  0.0006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0803  glycoside hydrolase family protein  21.35 
 
 
1162 aa  47.8  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0985  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 
994 aa  47  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.369995  normal  0.376092 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0327  Protein of unknown function DUF2223  29.05 
 
 
273 aa  47.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.590308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  38.67 
 
 
1061 aa  45.8  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>