54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2807 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 
814 aa  1686    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  39.08 
 
 
802 aa  578  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.52 
 
 
803 aa  571  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.36 
 
 
801 aa  557  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.83 
 
 
800 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.83 
 
 
692 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.83 
 
 
681 aa  498  1e-139  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  37.08 
 
 
835 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.62 
 
 
761 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  35.19 
 
 
786 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.19 
 
 
786 aa  456  1e-127  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  37.43 
 
 
715 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  34.81 
 
 
881 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.81 
 
 
882 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  33.81 
 
 
881 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  34.68 
 
 
882 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.43 
 
 
798 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  33.64 
 
 
1160 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.93 
 
 
838 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.12 
 
 
808 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.12 
 
 
808 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.25 
 
 
858 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  31.59 
 
 
847 aa  342  1e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.47 
 
 
860 aa  342  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.89 
 
 
837 aa  342  2e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.87 
 
 
858 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.87 
 
 
858 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.44 
 
 
840 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.77 
 
 
820 aa  335  1e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.59 
 
 
838 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.03 
 
 
841 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.12 
 
 
803 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.96 
 
 
833 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.65 
 
 
817 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.17 
 
 
821 aa  305  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.4 
 
 
777 aa  302  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  29.78 
 
 
1592 aa  278  2e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.55 
 
 
1505 aa  278  4e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.16 
 
 
1132 aa  275  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.81 
 
 
433 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.17 
 
 
430 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  22.19 
 
 
673 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  40.98 
 
 
180 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  40.98 
 
 
180 aa  58.5  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  22.45 
 
 
647 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  22.11 
 
 
627 aa  50.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  20.51 
 
 
621 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  22.67 
 
 
644 aa  50.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  21.01 
 
 
621 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  23.5 
 
 
604 aa  48.9  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.11 
 
 
645 aa  47.8  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  20.05 
 
 
621 aa  47.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  22.38 
 
 
668 aa  45.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  23.71 
 
 
615 aa  45.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>