63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2108 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2108  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 692 aa  1426    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.860324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2482  glucan 1,4-alpha-glucosidase  100 
 
 		 681 aa  1402    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.40631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2807  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.83 
 
 		 814 aa  513  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  44.66 
 
 		 800 aa  503  1e-141  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7572  glucan 1,4-alpha-glucosidase  42.84 
 
 		 801 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.99 
 
 		 802 aa  493  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  41.62 
 
 		 803 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.34 
 
 		 761 aa  457  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  40.26 
 
 		 715 aa  449  1e-125  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0098  putative glucoamylase precursor  40.23 
 
 		 835 aa  419  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.519208 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1878  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  39.97 
 
 		 786 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2224  glycosyl hydrolase, family 15  39.97 
 
 		 786 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0213  glucan 1,4- a-glucosidase  34.87 
 
 		 881 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1658  putative amylase  35.08 
 
 		 881 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0200  putative glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.28 
 
 		 882 aa  399  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0289  glycosy hydrolase family protein  35.28 
 
 		 882 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0725  glucan 1,4-alpha-glucosidase  38.14 
 
 		 798 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.928559 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4198  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.42 
 
 		 860 aa  361  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.116621 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.63 
 
 		 838 aa  360  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2973  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.55 
 
 		 808 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3146  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.55 
 
 		 808 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.02 
 
 		 841 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1924  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.38 
 
 		 837 aa  355  1e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2459  glucoamylase  33.98 
 
 		 847 aa  356  1e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.04 
 
 		 840 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.5 
 
 		 838 aa  349  8e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  34.41 
 
 		 1160 aa  345  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.37 
 
 		 833 aa  345  2e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26980  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.12 
 
 		 821 aa  340  5.9999999999999996e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1775  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.96 
 
 		 820 aa  336  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.039992  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.32 
 
 		 858 aa  335  2e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.81 
 
 		 858 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.81 
 
 		 858 aa  332  2e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0600  glucan 1,4-alpha-glucosidase  34.12 
 
 		 803 aa  329  1.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.782698  normal  0.698783 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1656  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.59 
 
 		 817 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.63 
 
 		 777 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  32.73 
 
 		 1505 aa  286  7e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  31.94 
 
 		 1592 aa  286  9e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7156  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.42 
 
 		 1132 aa  258  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0565327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  33.81 
 
 		 433 aa  187  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2348  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.86 
 
 		 430 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  23.22 
 
 		 615 aa  85.5  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  21.6 
 
 		 647 aa  77.8  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  25.16 
 
 		 668 aa  70.5  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  25.42 
 
 		 604 aa  69.3  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  28.49 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  27.78 
 
 		 621 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  22.47 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.71 
 
 		 670 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  25 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  25.95 
 
 		 644 aa  64.7  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  27.78 
 
 		 621 aa  63.9  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  20.85 
 
 		 611 aa  61.6  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  25.84 
 
 		 673 aa  61.2  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.54 
 
 		 649 aa  61.2  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.47 
 
 		 627 aa  60.8  0.00000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  23.78 
 
 		 621 aa  58.5  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.95 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1858  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0683623  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1536  hypothetical protein  34.78 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.0276141 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  24.94 
 
 		 663 aa  54.7  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  26.56 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  29.45 
 
 		 487 aa  43.9  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>