17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0545 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0545  glucan 14-alpha-glucosidase  100 
 
 		 734 aa  1452    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1149  glucan 14-alpha-glucosidase  51.1 
 
 		 715 aa  612  1e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2647  Glucoamylase and related glycosyl hydrolase- like protein  50.49 
 
 		 683 aa  587  1e-166  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1053  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  43.78 
 
 		 1505 aa  489  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.498818  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1503  glycoside hydrolase 15-related  40.37 
 
 		 1592 aa  437  1e-121  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.547945 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  27.51 
 
 		 647 aa  93.6  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  25.65 
 
 		 673 aa  86.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  26.1 
 
 		 615 aa  76.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  23.07 
 
 		 642 aa  72  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  24.14 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  22.67 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  22.2 
 
 		 611 aa  59.7  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  20.83 
 
 		 627 aa  55.5  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  22.5 
 
 		 645 aa  52.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  24.41 
 
 		 668 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  28.05 
 
 		 621 aa  44.7  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  31.5 
 
 		 650 aa  44.3  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>