56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  100 
 
 		 549 aa  1054    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  49.31 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  47.42 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  51.43 
 
 		 402 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10260  hypothetical protein  45.98 
 
 		 466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0187  glucoamylase-related glycosyl hydrolase-like protein  38.12 
 
 		 485 aa  213  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  41.54 
 
 		 484 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  41.31 
 
 		 412 aa  196  9e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  26.34 
 
 		 604 aa  79.3  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  25.85 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  25.26 
 
 		 668 aa  72.8  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  26.03 
 
 		 644 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  26.36 
 
 		 627 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  22.19 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  22.04 
 
 		 647 aa  65.1  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  24.22 
 
 		 670 aa  64.7  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.88 
 
 		 645 aa  64.3  0.000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  22.6 
 
 		 569 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  24.17 
 
 		 621 aa  62.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  23.12 
 
 		 615 aa  62  0.00000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  25.72 
 
 		 663 aa  62  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.46 
 
 		 621 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  22.1 
 
 		 621 aa  60.8  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  23.76 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  25.96 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.14 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  23.41 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  23.17 
 
 		 611 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  25.94 
 
 		 650 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  28.74 
 
 		 612 aa  52.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2196  glycoside hydrolase family protein 15  30.08 
 
 		 625 aa  51.2  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119453  decreased coverage  0.00245917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  29.89 
 
 		 610 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  28.57 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2015  glycoside hydrolase 15-related  27.82 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0969063 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05440  glycosyl hydrolase, putative  22.94 
 
 		 656 aa  47.8  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  26.12 
 
 		 642 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0758  glycoside hydrolase 15-related  20.47 
 
 		 363 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.628366  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  24.41 
 
 		 610 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0290  glycoside hydrolase 15-related  27.66 
 
 		 869 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  27.78 
 
 		 673 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  30.46 
 
 		 600 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.93 
 
 		 761 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3936  glycoside hydrolase 15-related  24.75 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00859022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  31.93 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  28.89 
 
 		 619 aa  45.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3597  glycosyl hydrolase  32.14 
 
 		 613 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0143916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2230  glycoside hydrolase 15-related  26.67 
 
 		 594 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  23.53 
 
 		 622 aa  45.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  33.62 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  37.33 
 
 		 611 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  31.54 
 
 		 598 aa  44.3  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  24.32 
 
 		 601 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  32.23 
 
 		 592 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  33.64 
 
 		 602 aa  43.9  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  25.97 
 
 		 592 aa  43.9  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4565  glycoside hydrolase 15-related protein  34.21 
 
 		 623 aa  43.5  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>