32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0187 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0187  glucoamylase-related glycosyl hydrolase-like protein  100 
 
 		 485 aa  957    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  38.16 
 
 		 549 aa  210  4e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  40.22 
 
 		 487 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  39.1 
 
 		 402 aa  196  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10260  hypothetical protein  37.53 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  36.71 
 
 		 472 aa  190  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  36.6 
 
 		 484 aa  163  8.000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  35.14 
 
 		 412 aa  133  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  25.67 
 
 		 569 aa  64.7  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  21.1 
 
 		 615 aa  55.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  27.2 
 
 		 650 aa  53.9  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  23.88 
 
 		 649 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  20.57 
 
 		 621 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  19.79 
 
 		 621 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  24.93 
 
 		 647 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  23.45 
 
 		 604 aa  50.8  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  21.55 
 
 		 621 aa  50.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  20.68 
 
 		 621 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  23.76 
 
 		 647 aa  49.3  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  24.72 
 
 		 668 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2349  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  21.51 
 
 		 645 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2453  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 858 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2337  glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 858 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2004  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.52 
 
 		 841 aa  44.7  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2201  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30.7 
 
 		 840 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.402848  decreased coverage  0.000000736169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2010  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  28.57 
 
 		 858 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00769756  hitchhiker  0.000340276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1873  glucan 1,4-alpha-glucosidase  30 
 
 		 833 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000067547  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1869  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.79 
 
 		 838 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2109  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.79 
 
 		 838 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.185275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4086  glucan 1,4-alpha-glucosidase  35.16 
 
 		 777 aa  43.9  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  26.26 
 
 		 622 aa  43.9  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>