25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5479 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  724    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  81.53 
 
 
354 aa  589  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  80.4 
 
 
354 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  53.54 
 
 
364 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  56.06 
 
 
380 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  56.55 
 
 
360 aa  364  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  50.82 
 
 
384 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  55.11 
 
 
353 aa  353  4e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  56.16 
 
 
414 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  54.3 
 
 
363 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  54.41 
 
 
350 aa  342  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  53.75 
 
 
393 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  51.91 
 
 
383 aa  334  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  54.85 
 
 
361 aa  332  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  48.08 
 
 
349 aa  292  6e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  44.81 
 
 
361 aa  269  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  39.82 
 
 
344 aa  242  6e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  44.72 
 
 
351 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  36.07 
 
 
365 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  33.74 
 
 
331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  26.71 
 
 
602 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  27.56 
 
 
610 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.16 
 
 
644 aa  43.1  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>