24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0389 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  719    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  68.93 
 
 		 364 aa  461  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  54.3 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  54.3 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  54.3 
 
 		 356 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  51.48 
 
 		 354 aa  332  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  52.37 
 
 		 354 aa  330  2e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  54.38 
 
 		 353 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  51.59 
 
 		 380 aa  319  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  52.42 
 
 		 383 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  52.31 
 
 		 350 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  53.29 
 
 		 361 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  50.49 
 
 		 393 aa  290  4e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  52.4 
 
 		 414 aa  290  4e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  45.56 
 
 		 384 aa  279  6e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  46.11 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  45 
 
 		 349 aa  269  5e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  42.35 
 
 		 361 aa  256  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  42.31 
 
 		 351 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  37.99 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  35.84 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  34.8 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  27.27 
 
 		 676 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  28.42 
 
 		 676 aa  47  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>