25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3875 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  56.55 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  56.55 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  56.55 
 
 		 356 aa  364  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  55.65 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  55.65 
 
 		 354 aa  349  5e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  49.26 
 
 		 364 aa  312  5.999999999999999e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  46.72 
 
 		 384 aa  299  6e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  47.16 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  51.93 
 
 		 361 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  49.19 
 
 		 414 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  46.61 
 
 		 363 aa  272  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  45.81 
 
 		 350 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  46.22 
 
 		 393 aa  268  8e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  45.8 
 
 		 353 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  48.16 
 
 		 383 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  43.75 
 
 		 361 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  40.69 
 
 		 349 aa  225  8e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  36.45 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  40.61 
 
 		 351 aa  199  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  35.95 
 
 		 365 aa  169  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  34.57 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  25.21 
 
 		 810 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  24.86 
 
 		 610 aa  47  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  24.52 
 
 		 604 aa  46.2  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>