22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0010 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  820    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  73.66 
 
 
393 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  56.16 
 
 
356 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  56.16 
 
 
356 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  56.16 
 
 
356 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  55.56 
 
 
354 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  54.3 
 
 
354 aa  359  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  50.15 
 
 
364 aa  323  4e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  51.21 
 
 
380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  55.12 
 
 
361 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  50.91 
 
 
363 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  50.29 
 
 
384 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  51.16 
 
 
353 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  51.3 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  49.53 
 
 
360 aa  302  8.000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  51.17 
 
 
350 aa  301  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  40.63 
 
 
349 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  42.41 
 
 
361 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  38.44 
 
 
344 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  41.93 
 
 
351 aa  232  8.000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  35.46 
 
 
365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  34.15 
 
 
331 aa  126  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>