22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0491 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  644    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  33.13 
 
 
354 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  34.57 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  32.83 
 
 
354 aa  137  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  35.46 
 
 
364 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  34.29 
 
 
356 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  34.29 
 
 
356 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  34.29 
 
 
356 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  32.92 
 
 
353 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  34.24 
 
 
384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  35.58 
 
 
380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  37.25 
 
 
383 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  36.72 
 
 
393 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  32.91 
 
 
414 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  35 
 
 
363 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  28.75 
 
 
349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  32.7 
 
 
351 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  35.83 
 
 
361 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  31.92 
 
 
350 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  26.26 
 
 
344 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  30.18 
 
 
365 aa  101  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>