25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0571 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  68.93 
 
 
363 aa  461  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  58.65 
 
 
380 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  54.81 
 
 
354 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  53.54 
 
 
356 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  53.54 
 
 
356 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  53.54 
 
 
356 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  53.43 
 
 
354 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  56.19 
 
 
353 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  53.69 
 
 
350 aa  350  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  54.06 
 
 
361 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  54.97 
 
 
383 aa  333  2e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  49.26 
 
 
360 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  47.25 
 
 
384 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  51.67 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  51.57 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  44.48 
 
 
361 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  44.84 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  41.37 
 
 
344 aa  243  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  41.92 
 
 
351 aa  231  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  33.24 
 
 
365 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  35.46 
 
 
331 aa  123  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  31.3 
 
 
610 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  26.72 
 
 
602 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00883  discoidin domain protein  30.2 
 
 
1044 aa  43.1  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0432744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>