24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0483 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  719    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  43.63 
 
 		 361 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  41.14 
 
 		 351 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  39.82 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  39.82 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  39.82 
 
 		 356 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  41.37 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  39.82 
 
 		 349 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  39.38 
 
 		 354 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  39.08 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  37.99 
 
 		 363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  42.55 
 
 		 353 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  40.62 
 
 		 380 aa  237  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  39.73 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  40.58 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  39.6 
 
 		 393 aa  225  9e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  38.21 
 
 		 365 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  39.09 
 
 		 350 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  36.45 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  37.54 
 
 		 361 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  35.06 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  25.62 
 
 		 331 aa  102  7e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  25.81 
 
 		 627 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  23.81 
 
 		 604 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>