27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8232 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  711    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  75.22 
 
 
353 aa  503  1e-141  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  65.43 
 
 
380 aa  432  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  57.76 
 
 
354 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  53.69 
 
 
364 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  56.56 
 
 
354 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  54.41 
 
 
356 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  54.41 
 
 
356 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  54.41 
 
 
356 aa  360  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  52.31 
 
 
363 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  51.25 
 
 
384 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  53.36 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  54.94 
 
 
361 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  51.4 
 
 
414 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  49.55 
 
 
383 aa  293  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  45.81 
 
 
360 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  40.06 
 
 
349 aa  238  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  40.91 
 
 
361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  39.09 
 
 
344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  43.25 
 
 
351 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  36.61 
 
 
365 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1705  hypothetical protein  30.72 
 
 
706 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.410139  hitchhiker  0.00605437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  25.89 
 
 
610 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  22.78 
 
 
644 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  31.4 
 
 
644 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  23.26 
 
 
621 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>