23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0012 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  789    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  73.66 
 
 		 414 aa  498  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  53.75 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  53.75 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  53.75 
 
 		 356 aa  358  7e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  52.34 
 
 		 354 aa  348  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  51.75 
 
 		 354 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  51.01 
 
 		 383 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  49.84 
 
 		 364 aa  315  7e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  52.17 
 
 		 350 aa  315  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  50.81 
 
 		 353 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  50.45 
 
 		 380 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  50 
 
 		 363 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  53.47 
 
 		 361 aa  299  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  46.22 
 
 		 360 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  45.21 
 
 		 384 aa  285  9e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  41.75 
 
 		 349 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  43.52 
 
 		 361 aa  239  6.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  42.9 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  37.03 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  35.84 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  37.07 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  24.24 
 
 		 627 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>