29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2139 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2139  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  765    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5100  hypothetical protein  51.91 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5188  hypothetical protein  51.91 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5479  hypothetical protein  51.91 
 
 		 356 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5716  hypothetical protein  53.12 
 
 		 354 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0571  hypothetical protein  53.35 
 
 		 364 aa  340  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.411459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1101  hypothetical protein  52.56 
 
 		 354 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.752129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  52.73 
 
 		 380 aa  335  5e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0389  hypothetical protein  51.45 
 
 		 363 aa  321  9.999999999999999e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  56.08 
 
 		 353 aa  319  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  55.7 
 
 		 361 aa  312  5.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0012  hypothetical protein  51.01 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0010  hypothetical protein  50.14 
 
 		 414 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2797  hypothetical protein  47.92 
 
 		 384 aa  294  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.421608  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  49.55 
 
 		 350 aa  292  6e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3220  hypothetical protein  47.09 
 
 		 349 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.137515  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3875  hypothetical protein  46.4 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0771  hypothetical protein  44.34 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2492  hypothetical protein  42.44 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0551706  normal  0.10549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0483  hypothetical protein  40.39 
 
 		 344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2008  hypothetical protein  36.89 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0491  hypothetical protein  36.47 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.298736  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  27.54 
 
 		 604 aa  54.3  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  25.6 
 
 		 602 aa  50.1  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2118  Glycogen debranching protein-like protein  32.98 
 
 		 810 aa  46.6  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.3 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  30.23 
 
 		 644 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  31.46 
 
 		 644 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  27.14 
 
 		 610 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>