10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1705 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1474    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.410139  hitchhiker  0.00605437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2343  hypothetical protein  47.26 
 
 		 677 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.266376  decreased coverage  0.000000338267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2294  hypothetical protein  46.42 
 
 		 735 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.922651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1627  hypothetical protein  43.88 
 
 		 692 aa  553  1e-156  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2170  Amylo-alpha-16-glucosidase  23.44 
 
 		 676 aa  65.5  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000556903  unclonable  0.00000000115329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8232  hypothetical protein  30.72 
 
 		 350 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1790  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  21.77 
 
 		 676 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2875  hypothetical protein  28.9 
 
 		 353 aa  50.1  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4269  hypothetical protein  23.42 
 
 		 1200 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0489651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3660  hypothetical protein  24.65 
 
 		 380 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.149235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>