16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0937 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  742    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1944  hypothetical protein  36.01 
 
 
360 aa  180  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4634  hypothetical protein  25.13 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  29.94 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  31.3 
 
 
378 aa  79.3  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  30.09 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1310  hypothetical protein  26.67 
 
 
382 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186399  normal  0.248493 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.59 
 
 
616 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2703  hypothetical protein  26.79 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0453731  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  26.87 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1427  hypothetical protein  27 
 
 
303 aa  60.5  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0693  hypothetical protein  27.66 
 
 
369 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4694  hypothetical protein  24.47 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5392  hypothetical protein  26.61 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  25.25 
 
 
744 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.07 
 
 
1024 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>