16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4930 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  764    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  29.78 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  32.11 
 
 
378 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  30.16 
 
 
409 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1310  hypothetical protein  28.94 
 
 
382 aa  60.8  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186399  normal  0.248493 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  28.76 
 
 
1024 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.56 
 
 
616 aa  59.3  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4694  hypothetical protein  27.67 
 
 
351 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0693  hypothetical protein  26.61 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  30.3 
 
 
376 aa  53.5  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4634  hypothetical protein  29.68 
 
 
381 aa  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1944  hypothetical protein  24.88 
 
 
360 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  29.78 
 
 
740 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  34.11 
 
 
744 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0403  two component regulator propeller domain protein  31.76 
 
 
711 aa  43.1  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  31.84 
 
 
794 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>