72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0403 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0403  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 711 aa  1371    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  28.18 
 
 		 1407 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  33.84 
 
 		 1008 aa  78.2  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  28.62 
 
 		 1346 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  28.57 
 
 		 1105 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  26.99 
 
 		 695 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  27.7 
 
 		 1370 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  22.84 
 
 		 1070 aa  64.3  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  28.24 
 
 		 357 aa  64.3  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.87 
 
 		 1024 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4114  two component regulator propeller domain-containing protein  29.37 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0168145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  26.86 
 
 		 1397 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  27.91 
 
 		 965 aa  61.6  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  22.17 
 
 		 1355 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  21.59 
 
 		 1054 aa  59.7  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  28.83 
 
 		 692 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  24.53 
 
 		 1306 aa  58.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  18.25 
 
 		 1400 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  28.23 
 
 		 1278 aa  57.8  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  26.43 
 
 		 1344 aa  57.4  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  32.17 
 
 		 967 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  22.53 
 
 		 1070 aa  56.2  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 1018 aa  56.2  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  21.8 
 
 		 1084 aa  55.5  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3143  two component regulator propeller domain protein  25.3 
 
 		 361 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  21.36 
 
 		 1374 aa  53.9  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1621  two component regulator propeller  25.43 
 
 		 425 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.83 
 
 		 1258 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 1453 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0230  two-component sensor histidine kinase/response regulator  26.98 
 
 		 177 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.949413  normal  0.193124 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  25 
 
 		 1363 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  25.1 
 
 		 1194 aa  51.2  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  24.38 
 
 		 1388 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 1211 aa  50.8  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 		 1505 aa  50.8  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.40172  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  22.49 
 
 		 1378 aa  50.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  23.04 
 
 		 987 aa  50.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  23.05 
 
 		 1526 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  25.79 
 
 		 534 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  20.77 
 
 		 1373 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  23.92 
 
 		 1349 aa  50.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  28.93 
 
 		 1021 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 		 1030 aa  50.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 		 1181 aa  48.9  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.09 
 
 		 1237 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  28.1 
 
 		 846 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  23.71 
 
 		 1378 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  25.23 
 
 		 1340 aa  48.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  23.19 
 
 		 1366 aa  47.4  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  25.38 
 
 		 1335 aa  47.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  23.39 
 
 		 1017 aa  47.4  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00965  Putative signal protein with GGDEF domain  26.48 
 
 		 973 aa  47.4  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.051643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06201  Putative signal protein with GGDEF domain  26.48 
 
 		 973 aa  47.4  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  23.21 
 
 		 1374 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  26.15 
 
 		 1351 aa  47  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  26.42 
 
 		 1404 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  24.86 
 
 		 1418 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.1 
 
 		 1414 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  25 
 
 		 1342 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  25.84 
 
 		 946 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  23.64 
 
 		 975 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 		 1242 aa  45.8  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  24.19 
 
 		 1347 aa  45.4  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.22 
 
 		 1508 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.16 
 
 		 1276 aa  45.1  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  20.3 
 
 		 1093 aa  44.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  24.43 
 
 		 1053 aa  44.7  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1960  two component regulator propeller domain-containing protein  26.42 
 
 		 2374 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 		 1226 aa  44.3  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  27.03 
 
 		 1250 aa  44.3  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  22.17 
 
 		 1313 aa  43.9  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  21.54 
 
 		 1374 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>