55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1621 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1621  two component regulator propeller  100 
 
 		 425 aa  866    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2949  two component regulator propeller domain-containing protein  58.97 
 
 		 397 aa  396  1e-109  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0297618  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  28.64 
 
 		 1114 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  27.96 
 
 		 357 aa  65.9  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  26.39 
 
 		 1346 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.66 
 
 		 1054 aa  64.7  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  28.07 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1872  sensor histidine kinase  24.66 
 
 		 1046 aa  56.6  0.0000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0403  two component regulator propeller domain protein  25.49 
 
 		 711 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1411  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.68 
 
 		 1430 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.017718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1476  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.68 
 
 		 1430 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65929  normal  0.14467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  28.27 
 
 		 1093 aa  53.9  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  21.19 
 
 		 987 aa  53.1  0.000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  24.74 
 
 		 597 aa  53.1  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4114  two component regulator propeller domain-containing protein  25.73 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0168145 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  24.13 
 
 		 1086 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  27.23 
 
 		 695 aa  51.2  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.4 
 
 		 1075 aa  51.2  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  25.82 
 
 		 1342 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.67 
 
 		 1508 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.67 
 
 		 1508 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4026  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.67 
 
 		 1508 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4145  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.67 
 
 		 1508 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  21.1 
 
 		 1334 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1464  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.23 
 
 		 1433 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000600207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3084  sensory box protein  30.69 
 
 		 1422 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1237 aa  47.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  23.55 
 
 		 1093 aa  47.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2774  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.57 
 
 		 1419 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  28 
 
 		 965 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2851  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.57 
 
 		 1419 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000359916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0415  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.15 
 
 		 1486 aa  46.2  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2757  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.57 
 
 		 1419 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  23.78 
 
 		 975 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  29.84 
 
 		 1250 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 1211 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  30.23 
 
 		 1008 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.97 
 
 		 1306 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  28.47 
 
 		 985 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.94 
 
 		 1258 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  21.88 
 
 		 1053 aa  45.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  24.71 
 
 		 1335 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  24.37 
 
 		 1366 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  27.94 
 
 		 1374 aa  43.9  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.61 
 
 		 1511 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.19 
 
 		 1118 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.29 
 
 		 1388 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  26.29 
 
 		 1175 aa  43.5  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4008  response regulator receiver  25 
 
 		 1374 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.83 
 
 		 1505 aa  43.1  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  24.46 
 
 		 1355 aa  43.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 1453 aa  43.1  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.76 
 
 		 1079 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01021  sensory box/GGDEF/EAL domain protein  29.36 
 
 		 1392 aa  43.1  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  26.28 
 
 		 1004 aa  43.1  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>