153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3143 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3143  two component regulator propeller domain protein  100 
 
 		 361 aa  732    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2155  two component regulator propeller domain protein  41.71 
 
 		 534 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.235717 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  25.48 
 
 		 1346 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 1258 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2243  hypothetical protein  30.97 
 
 		 846 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  25.32 
 
 		 1024 aa  87  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  26.45 
 
 		 1363 aa  85.9  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  25.74 
 
 		 1370 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0921  histidine kinase  27.04 
 
 		 1105 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.615746 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  22.62 
 
 		 1017 aa  84  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  25 
 
 		 1355 aa  83.6  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0790  two component regulator propeller domain-containing protein  24.79 
 
 		 692 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  25.92 
 
 		 1400 aa  83.2  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  22.19 
 
 		 1008 aa  83.2  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  28.78 
 
 		 1054 aa  82.8  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1429  two component regulator propeller domain protein  25.48 
 
 		 695 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191766  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  31.45 
 
 		 1344 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  25.92 
 
 		 1070 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  25.3 
 
 		 1397 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  27.54 
 
 		 1378 aa  80.1  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  26.72 
 
 		 1374 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  27.16 
 
 		 1324 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  37.6 
 
 		 1378 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.92 
 
 		 1278 aa  79.7  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  23.63 
 
 		 965 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  26.21 
 
 		 1351 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  28.4 
 
 		 1327 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  23.97 
 
 		 1407 aa  77  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  25.07 
 
 		 1526 aa  75.5  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  26.46 
 
 		 1070 aa  75.9  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  25.21 
 
 		 1306 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3041  histidine kinase  21.94 
 
 		 1175 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.551193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1225  diguanylate cyclase with beta propeller sensor  22.5 
 
 		 985 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.90661  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4115  two component regulator propeller domain-containing protein  23.74 
 
 		 357 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0684737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 1211 aa  74.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  23.03 
 
 		 1388 aa  73.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  24.93 
 
 		 1349 aa  72  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  26.38 
 
 		 1313 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  24.4 
 
 		 975 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  25.41 
 
 		 1334 aa  71.6  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  21.07 
 
 		 1396 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  25.09 
 
 		 1114 aa  70.9  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0755  GGDEF domain-containing protein  24.86 
 
 		 1053 aa  70.1  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  27.85 
 
 		 1118 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5389  histidine kinase  25.08 
 
 		 1414 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.157534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  25.1 
 
 		 1278 aa  69.7  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  26.91 
 
 		 1034 aa  68.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.43 
 
 		 1226 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0156  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.45 
 
 		 1075 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000640114  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  21.49 
 
 		 1498 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  23.08 
 
 		 1250 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2339  histidine kinase  20.82 
 
 		 1009 aa  67.8  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3042  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.89 
 
 		 1181 aa  67.4  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.227036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  26.87 
 
 		 1340 aa  67  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  22.56 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  25.12 
 
 		 1373 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2605  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.45 
 
 		 1453 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  26.57 
 
 		 1051 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.58 
 
 		 1276 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  24.06 
 
 		 1342 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  22.79 
 
 		 1335 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  24.17 
 
 		 1343 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  22.94 
 
 		 1373 aa  64.3  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  22.91 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01691  histidine kinase/response regulator hybrid protein  21.14 
 
 		 1185 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.578363  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.45 
 
 		 1079 aa  63.9  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4600  two component regulator propeller domain protein  26.72 
 
 		 1194 aa  63.5  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.779291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4985  sensory box protein  26.03 
 
 		 1534 aa  63.2  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  24.55 
 
 		 1355 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  25.3 
 
 		 1366 aa  63.5  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  26.15 
 
 		 1418 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  28.68 
 
 		 975 aa  62.8  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.36 
 
 		 1030 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  23.44 
 
 		 1347 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  24.69 
 
 		 1374 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  29.96 
 
 		 1316 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.56 
 
 		 1242 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  31.9 
 
 		 1017 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  27.75 
 
 		 1384 aa  60.5  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  25.7 
 
 		 1021 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3749  putative signal transduction histidine kinase  21.86 
 
 		 1018 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0973084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  24.55 
 
 		 1063 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1316  diguanylate cyclase  24.27 
 
 		 1004 aa  58.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.730261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24 
 
 		 1237 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  28 
 
 		 1086 aa  57.8  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  21.39 
 
 		 1093 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  24.14 
 
 		 967 aa  57.4  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  26.96 
 
 		 1005 aa  57  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3648  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.14 
 
 		 1511 aa  57  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  23.6 
 
 		 1404 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.43 
 
 		 1093 aa  56.6  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  27.97 
 
 		 946 aa  57  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.12 
 
 		 1508 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3829  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.83 
 
 		 1505 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1105  signal transduction histidine kinase-like protein  23.1 
 
 		 1141 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4114  two component regulator propeller domain-containing protein  28.35 
 
 		 377 aa  54.3  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0168145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3950  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.14 
 
 		 1508 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0967  GGDEF family protein  19.83 
 
 		 976 aa  53.9  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.1127  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0403  two component regulator propeller domain protein  25.6 
 
 		 711 aa  53.9  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  21.02 
 
 		 1192 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>