More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5951 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 975 aa  2009    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  25.12 
 
 		 1051 aa  234  6e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1280  signal transduction histidine kinase, LytS  27.66 
 
 		 1015 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0152278  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5621  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 1258 aa  159  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.879931  normal  0.634334 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6624  signal transduction histidine kinase, LytS  37.14 
 
 		 650 aa  158  5.0000000000000005e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.11241 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  40.37 
 
 		 1192 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1007  signal transduction histidine kinase, LytS  35.29 
 
 		 684 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.11 
 
 		 1363 aa  145  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  34.57 
 
 		 1182 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  33.46 
 
 		 541 aa  139  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01910  Autolysin sensor kinase  37.5 
 
 		 729 aa  136  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.665726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3977  signal transduction histidine kinase, LytS  38.35 
 
 		 675 aa  136  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.932944  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  21.84 
 
 		 1373 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0255  sensor protein  31.6 
 
 		 631 aa  131  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  21.64 
 
 		 1370 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4193  histidine kinase  22.23 
 
 		 1400 aa  128  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00660029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  36.5 
 
 		 671 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_105  histidine kinase CheY-like domain protein  20.99 
 
 		 1070 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 366 aa  121  6e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  21.88 
 
 		 1378 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  23.02 
 
 		 1342 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  30.9 
 
 		 587 aa  114  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0275  histidine kinase  21.68 
 
 		 1070 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  25.89 
 
 		 1021 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0672  signal transduction histidine kinase, LytS  32.47 
 
 		 289 aa  112  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  20.48 
 
 		 1313 aa  112  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  32.5 
 
 		 380 aa  111  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1584  histidine kinase internal region  36.96 
 
 		 304 aa  111  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0238683 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  21.52 
 
 		 1306 aa  111  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.88 
 
 		 362 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4681  GGDEF domain-containing protein  23.19 
 
 		 1034 aa  110  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4159  histidine kinase  21.62 
 
 		 1017 aa  109  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0934723  normal  0.139569 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  21.89 
 
 		 1374 aa  109  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  33.48 
 
 		 414 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2019  histidine kinase  21.62 
 
 		 1316 aa  109  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 388 aa  108  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  22.72 
 
 		 1024 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 446 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  29.52 
 
 		 342 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  29 
 
 		 367 aa  104  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.05 
 
 		 1396 aa  104  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  21.75 
 
 		 1397 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  22.06 
 
 		 1334 aa  103  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 422 aa  103  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2657  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 478 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1301  two component regulator propeller domain protein  22.7 
 
 		 1008 aa  102  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.503431  normal  0.30236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 600 aa  102  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  30 
 
 		 420 aa  102  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 		 349 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  21.13 
 
 		 1404 aa  101  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 393 aa  101  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  33.52 
 
 		 589 aa  101  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  33.52 
 
 		 589 aa  101  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  33.52 
 
 		 589 aa  101  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  33.52 
 
 		 589 aa  101  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  33.52 
 
 		 522 aa  101  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  33.52 
 
 		 589 aa  101  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  33.52 
 
 		 589 aa  101  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  33.16 
 
 		 589 aa  101  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  33.52 
 
 		 589 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1617  ATP-binding region ATPase domain protein  21.07 
 
 		 975 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2733  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  21.19 
 
 		 965 aa  100  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.77 
 
 		 568 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.03 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  33.94 
 
 		 642 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05925  GGDEF domain protein  22.33 
 
 		 1005 aa  100  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.40002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 348 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.64 
 
 		 414 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 412 aa  99.4  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 389 aa  99.4  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32.39 
 
 		 358 aa  99.4  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  30.6 
 
 		 410 aa  99.4  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 357 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 367 aa  99  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  31.88 
 
 		 579 aa  98.6  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  31.87 
 
 		 443 aa  98.6  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  31.87 
 
 		 390 aa  98.6  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  33.53 
 
 		 357 aa  98.6  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  26.64 
 
 		 381 aa  98.2  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.5 
 
 		 1237 aa  98.2  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  29.05 
 
 		 1114 aa  97.4  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 446 aa  97.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  34.19 
 
 		 394 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  31.36 
 
 		 604 aa  96.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  32.63 
 
 		 591 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0667  response regulator receiver domain-containing protein  19.76 
 
 		 1526 aa  96.7  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0280955  hitchhiker  0.000000898802 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  30.04 
 
 		 414 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  21.36 
 
 		 1030 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223882  normal  0.750566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  35.29 
 
 		 603 aa  96.3  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  29.36 
 
 		 568 aa  96.7  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  33.12 
 
 		 591 aa  96.3  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02778  GGDEF protein  20.94 
 
 		 946 aa  95.5  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  32.7 
 
 		 330 aa  95.5  4e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 		 589 aa  95.5  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  28.96 
 
 		 594 aa  95.1  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.56 
 
 		 370 aa  95.1  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  29.17 
 
 		 374 aa  95.1  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  28.66 
 
 		 340 aa  94.7  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  36.08 
 
 		 578 aa  94.7  7e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  33.97 
 
 		 607 aa  94.7  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>