More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0228 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  100 
 
 		 381 aa  763    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  66.01 
 
 		 374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  57.1 
 
 		 369 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  38.44 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  37.11 
 
 		 357 aa  236  6e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  36.31 
 
 		 360 aa  228  9e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  36.36 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  36.46 
 
 		 379 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  33.24 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  41.47 
 
 		 642 aa  179  9e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  36.18 
 
 		 362 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  41.2 
 
 		 389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 388 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  39.83 
 
 		 586 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  39.83 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.8 
 
 		 607 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 394 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  36.69 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  37.9 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  36.55 
 
 		 420 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.12 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 422 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.04 
 
 		 576 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  36.89 
 
 		 382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 370 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  33.86 
 
 		 349 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 482 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  27.84 
 
 		 346 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 559 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  37.5 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  33.94 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  33.94 
 
 		 565 aa  125  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  33.94 
 
 		 559 aa  125  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  34.66 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  29.8 
 
 		 414 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 		 565 aa  123  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  36.95 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  36.6 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  37.79 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  34.55 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  30.04 
 
 		 340 aa  120  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  33.5 
 
 		 575 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  33.18 
 
 		 577 aa  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  34.38 
 
 		 568 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 568 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 578 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  32.51 
 
 		 342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  31.92 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 412 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  40.57 
 
 		 364 aa  117  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  31.13 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  36.27 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  31.06 
 
 		 428 aa  116  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.24 
 
 		 580 aa  116  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 557 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 557 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  30.66 
 
 		 410 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 		 405 aa  115  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  32.73 
 
 		 450 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  30.35 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0148  putative sensor with HAMP domain  31.94 
 
 		 594 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  31.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 561 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 558 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  32.91 
 
 		 831 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  33.97 
 
 		 576 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  36.32 
 
 		 438 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  31.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  26.65 
 
 		 367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 491 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  29.76 
 
 		 370 aa  114  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1582  signal transduction histidine kinase, LytS  30.09 
 
 		 498 aa  113  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0045193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>