More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5317 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  100 
 
 
364 aa  719    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  62.04 
 
 
366 aa  371  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1948  histidine kinase internal region  67.16 
 
 
354 aa  364  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.78828  hitchhiker  0.00774821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  63.69 
 
 
347 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  62.13 
 
 
352 aa  341  1e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1353  histidine kinase internal region  68.92 
 
 
384 aa  340  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  67.38 
 
 
355 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  66.77 
 
 
355 aa  317  2e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3097  histidine kinase internal region  57.73 
 
 
372 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  49.24 
 
 
349 aa  259  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1112  putative two-component system sensor protein  48.46 
 
 
318 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0563295  normal  0.307234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  44.27 
 
 
341 aa  195  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  34.25 
 
 
340 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  39.34 
 
 
358 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1434  histidine kinase internal region  39.74 
 
 
369 aa  159  5e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.675991  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  37.54 
 
 
358 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  42.34 
 
 
358 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  38.79 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  40.91 
 
 
360 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3532  histidine kinase internal region  37.12 
 
 
338 aa  152  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.928574  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  40.91 
 
 
360 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  41.54 
 
 
372 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04139  two-component system sensor protein  36.93 
 
 
350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.821661  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  36.47 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  41.29 
 
 
364 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  40.53 
 
 
576 aa  139  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  36.76 
 
 
343 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 
446 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  41.29 
 
 
362 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  40.76 
 
 
381 aa  136  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0014  signal transduction histidine kinase, LytS  36.03 
 
 
346 aa  134  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.292227 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1227  histidine kinase internal region  40.18 
 
 
341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1260  two-component system, sensor protein  40.18 
 
 
332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 
367 aa  133  6e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  41.34 
 
 
576 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.4 
 
 
414 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 
374 aa  130  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 
367 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  38 
 
 
465 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 
572 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  39.25 
 
 
369 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.95 
 
 
578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  34.77 
 
 
420 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  37.93 
 
 
557 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  37.93 
 
 
557 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  37.93 
 
 
557 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 
403 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 
374 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  38.73 
 
 
358 aa  123  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  37.93 
 
 
557 aa  123  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  36.41 
 
 
357 aa  123  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  34.85 
 
 
340 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  29.53 
 
 
405 aa  122  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  38.31 
 
 
389 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  35.84 
 
 
568 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  37.14 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  43.86 
 
 
359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
422 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  38.37 
 
 
360 aa  120  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 
393 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  36.78 
 
 
557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  36.78 
 
 
557 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  36.93 
 
 
645 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
357 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  39.31 
 
 
491 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  34.03 
 
 
428 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 
398 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  36.84 
 
 
394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  34.67 
 
 
363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  38.98 
 
 
607 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  33.84 
 
 
370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 
565 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  37.89 
 
 
391 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 
394 aa  116  6e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  39.6 
 
 
390 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  36.72 
 
 
580 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  37.36 
 
 
563 aa  116  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  36.26 
 
 
426 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  36.99 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.08 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  35.36 
 
 
377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.08 
 
 
565 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  34.72 
 
 
374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 
559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
559 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  37.3 
 
 
831 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  34.33 
 
 
342 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 
450 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  43.75 
 
 
360 aa  113  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  36.02 
 
 
1016 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
361 aa  113  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  35.08 
 
 
350 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>