More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2442 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 367 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.19 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  36.99 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  37.15 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  40.33 
 
 		 342 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 422 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  32.95 
 
 		 420 aa  179  8e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  38.59 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  34.45 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  44.7 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  44.7 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  44.7 
 
 		 339 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  44.7 
 
 		 449 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  44.24 
 
 		 360 aa  153  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  40.89 
 
 		 419 aa  152  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  33.04 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  43.78 
 
 		 336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  43.78 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 363 aa  145  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 388 aa  142  8e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1070  histidine kinase internal region  34.73 
 
 		 368 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.480376  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  37.86 
 
 		 262 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  39.57 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  33.64 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  37.16 
 
 		 576 aa  138  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  38.74 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.069158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  34.75 
 
 		 377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  37 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 580 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  31.51 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  35.17 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 257 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4248  sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 257 aa  133  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  38.33 
 
 		 366 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 357 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  39.17 
 
 		 568 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  34.53 
 
 		 403 aa  132  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  34.8 
 
 		 578 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 572 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  37.25 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  36.07 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 557 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  29.66 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  36.08 
 
 		 389 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  35.02 
 
 		 390 aa  129  7.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 557 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  40.62 
 
 		 557 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 		 568 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  40.1 
 
 		 557 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  33.33 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  40.1 
 
 		 557 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  33.2 
 
 		 392 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  37.5 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  43.75 
 
 		 603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  40.1 
 
 		 557 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 831 aa  127  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  39.55 
 
 		 557 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.49 
 
 		 576 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35.85 
 
 		 465 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  35.38 
 
 		 370 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  35.59 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  33.2 
 
 		 565 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  33.2 
 
 		 565 aa  126  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  33.2 
 
 		 565 aa  126  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  35.22 
 
 		 369 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  33.76 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  38.5 
 
 		 567 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  33.76 
 
 		 559 aa  126  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  37.17 
 
 		 491 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 357 aa  125  8.000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  37.43 
 
 		 341 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0918  histidine kinase  39.11 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 565 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 		 586 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 369 aa  123  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 346 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  35.78 
 
 		 563 aa  123  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  35.14 
 
 		 556 aa  123  5e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 645 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  36.1 
 
 		 394 aa  122  7e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  35.11 
 
 		 556 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.41 
 
 		 563 aa  122  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  38.97 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  36.6 
 
 		 381 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  38.46 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  32.08 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  35.19 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.67 
 
 		 556 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  32.95 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>