More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2263 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 369 aa  739    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  54.14 
 
 		 367 aa  323  2e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  51.92 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1070  histidine kinase internal region  54.14 
 
 		 368 aa  300  3e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.480376  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.2 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.069158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  45.95 
 
 		 363 aa  259  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  37.58 
 
 		 390 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  35.84 
 
 		 414 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  35.22 
 
 		 420 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.42 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  42.98 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  42.98 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  42.98 
 
 		 339 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  44.29 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  35.22 
 
 		 367 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  41.23 
 
 		 360 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  40.88 
 
 		 336 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  40.51 
 
 		 336 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  43.54 
 
 		 419 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  34.45 
 
 		 340 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  36.19 
 
 		 342 aa  142  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  39.41 
 
 		 359 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 446 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  41.15 
 
 		 262 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.74 
 
 		 357 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.66 
 
 		 346 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 388 aa  126  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  36.06 
 
 		 831 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  35.39 
 
 		 374 aa  123  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.18 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  37.6 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 		 568 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  36.97 
 
 		 642 aa  116  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  37.33 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  34.23 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  32.08 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 465 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.26 
 
 		 568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  34.98 
 
 		 575 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 561 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  33.94 
 
 		 390 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 561 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 561 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 561 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 561 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 561 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  35.07 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  37.44 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 561 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2602  histidine kinase  44.94 
 
 		 173 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  34.95 
 
 		 400 aa  109  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 565 aa  109  7.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  33.18 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  32.69 
 
 		 576 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 578 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  34.45 
 
 		 561 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 559 aa  108  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  29.41 
 
 		 582 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  29.41 
 
 		 552 aa  108  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  30.21 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  30.21 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  30.21 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  34.62 
 
 		 560 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  30.21 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 559 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  35.68 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 580 aa  107  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 572 aa  107  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 572 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  28.57 
 
 		 584 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  28.57 
 
 		 584 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  33.03 
 
 		 576 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  32.88 
 
 		 607 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  33.48 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  31.42 
 
 		 403 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  31.13 
 
 		 581 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  30.98 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  35.11 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  30.99 
 
 		 431 aa  104  2e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  29.13 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  31.02 
 
 		 408 aa  104  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 581 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  27.43 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>