More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0386 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  738    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  44 
 
 		 342 aa  288  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  44.69 
 
 		 340 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  41.67 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  40.5 
 
 		 420 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  33.97 
 
 		 367 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  36.45 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  37.28 
 
 		 389 aa  150  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  41.85 
 
 		 360 aa  145  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  40.26 
 
 		 449 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  40.26 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  40.26 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  40.26 
 
 		 339 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  40.26 
 
 		 336 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  32.25 
 
 		 355 aa  139  7.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  39.83 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  37.31 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  36.59 
 
 		 262 aa  134  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  29.66 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  34.45 
 
 		 352 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 		 578 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 357 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.22 
 
 		 346 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  36.63 
 
 		 372 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.33 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  39.41 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.069158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  31.1 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 482 aa  123  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  31.28 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  35 
 
 		 645 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.2 
 
 		 360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31.89 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  28.78 
 
 		 377 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  37.71 
 
 		 341 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  32.85 
 
 		 394 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  35.37 
 
 		 362 aa  119  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  27.59 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.74 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  34.26 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  35.75 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 357 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  37.85 
 
 		 349 aa  115  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  32.03 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 384 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  30.08 
 
 		 392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 552 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  33.48 
 
 		 358 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  35.63 
 
 		 556 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.06 
 
 		 556 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1070  histidine kinase internal region  29.38 
 
 		 368 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.480376  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.18 
 
 		 576 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.06 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  32.75 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  36.41 
 
 		 558 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  34.36 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.7 
 
 		 568 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  41.22 
 
 		 572 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  33.84 
 
 		 446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  38.92 
 
 		 358 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  27.27 
 
 		 394 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  32.24 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  34.91 
 
 		 576 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  31.54 
 
 		 391 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  33.49 
 
 		 432 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  40.88 
 
 		 366 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  35.86 
 
 		 569 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  29.35 
 
 		 350 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  33.49 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  32 
 
 		 360 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  30.95 
 
 		 591 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  31.64 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  33.97 
 
 		 455 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 580 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1711  histidine kinase internal protein  38.89 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.462992  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  33.49 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  32.12 
 
 		 360 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 576 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 580 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  41.99 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4117  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 565 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.645201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  35.93 
 
 		 556 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  107  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1247  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 		 831 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  29.63 
 
 		 403 aa  106  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  35.16 
 
 		 600 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 374 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  31.23 
 
 		 303 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>