More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1289 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  95.01 
 
 		 422 aa  805    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  846    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  76.6 
 
 		 414 aa  618  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  56.01 
 
 		 389 aa  345  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  55.88 
 
 		 390 aa  338  9.999999999999999e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  39.38 
 
 		 340 aa  198  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  35.69 
 
 		 342 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  39.22 
 
 		 367 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  34.42 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  33.51 
 
 		 367 aa  169  6e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  33.7 
 
 		 355 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1070  histidine kinase internal region  33.51 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.480376  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  40.5 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  37.2 
 
 		 419 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  36.41 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  35.22 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  42.15 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  42.6 
 
 		 360 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  42.15 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  42.15 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  42.15 
 
 		 339 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  37.44 
 
 		 374 aa  144  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  41.7 
 
 		 336 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  41.7 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.02 
 
 		 389 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  36.55 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  38.16 
 
 		 262 aa  140  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 371 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.069158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.93 
 
 		 578 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  37.93 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.68 
 
 		 357 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.66 
 
 		 465 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 394 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  42.39 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  34.96 
 
 		 586 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  34.5 
 
 		 607 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  35.48 
 
 		 428 aa  124  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 384 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 357 aa  123  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0852  putative sensor with HAMP domain  29 
 
 		 610 aa  122  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  37.88 
 
 		 558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  38.46 
 
 		 560 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.39 
 
 		 346 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  35.22 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  31.23 
 
 		 358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  33.04 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  33.6 
 
 		 390 aa  120  6e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  33.17 
 
 		 350 aa  119  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  35.56 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  40.88 
 
 		 556 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.49 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  37.26 
 
 		 568 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  35.81 
 
 		 366 aa  118  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  31.73 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  31.73 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 566 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  31.73 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 561 aa  118  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  32.56 
 
 		 576 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  37.44 
 
 		 374 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  35.4 
 
 		 581 aa  117  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  31.73 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  32.09 
 
 		 410 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  37.68 
 
 		 580 aa  117  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 566 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 561 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  37.63 
 
 		 556 aa  116  8.999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  32.42 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  34.8 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 561 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  32.42 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  32.42 
 
 		 559 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  35.48 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  32.42 
 
 		 565 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  35.21 
 
 		 403 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  27.39 
 
 		 414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  34.27 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  31.96 
 
 		 559 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2551  signal transduction histidine kinase, LytS  31.69 
 
 		 600 aa  114  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1247  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  35.91 
 
 		 568 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  35.84 
 
 		 576 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0903  signal transduction histidine kinase, LytS  31.71 
 
 		 587 aa  114  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  42.48 
 
 		 603 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 403 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>