More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_00850 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  100 
 
 		 428 aa  872    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  55.2 
 
 		 428 aa  436  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  45.78 
 
 		 394 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  43.22 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  46.59 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  43.07 
 
 		 394 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  43.51 
 
 		 398 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  45.01 
 
 		 411 aa  297  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  44.2 
 
 		 394 aa  290  4e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  42.9 
 
 		 393 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  43.85 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  43.85 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  43.85 
 
 		 403 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  44.15 
 
 		 408 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  41.99 
 
 		 374 aa  283  5.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  44.85 
 
 		 408 aa  283  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  44.97 
 
 		 409 aa  279  5e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  44.19 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  53.56 
 
 		 402 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  43.86 
 
 		 405 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  41.19 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  41.32 
 
 		 432 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  45.31 
 
 		 363 aa  222  8e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  45.42 
 
 		 325 aa  214  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 572 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  35.65 
 
 		 576 aa  201  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  48.26 
 
 		 338 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  31.44 
 
 		 465 aa  189  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  35.18 
 
 		 446 aa  188  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  35.12 
 
 		 455 aa  184  4.0000000000000006e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  32.78 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  31.68 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  33.61 
 
 		 568 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 580 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  31.93 
 
 		 576 aa  177  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 561 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 426 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  29.58 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  29.58 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  33.05 
 
 		 576 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  29.58 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  29.58 
 
 		 561 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.24 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 561 aa  171  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  29.1 
 
 		 563 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  29.86 
 
 		 561 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 561 aa  170  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.19 
 
 		 567 aa  169  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 563 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3061  signal transduction histidine kinase, LytS  32.27 
 
 		 560 aa  166  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2724  signal transduction histidine kinase, LytS  28.73 
 
 		 562 aa  166  8e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  29.65 
 
 		 569 aa  166  9e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3169  signal transduction histidine kinase, LytS  32.27 
 
 		 560 aa  166  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 578 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  27.71 
 
 		 557 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 		 603 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  31.98 
 
 		 577 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 561 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0245  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 584 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  29.77 
 
 		 584 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 558 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  30.03 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  28.65 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  29.24 
 
 		 556 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  28.65 
 
 		 572 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4588  signal transduction histidine kinase, LytS  29.11 
 
 		 561 aa  157  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  28 
 
 		 558 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  29.46 
 
 		 563 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3044  signal transduction histidine kinase, LytS  30.24 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 560 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 560 aa  156  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 560 aa  156  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 560 aa  156  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  28.74 
 
 		 565 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  29.74 
 
 		 556 aa  156  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01150  putative regulator of cell autolysis  29.65 
 
 		 440 aa  155  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 565 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  30.34 
 
 		 559 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  29.31 
 
 		 565 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  29.61 
 
 		 568 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  27.83 
 
 		 591 aa  154  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  28.86 
 
 		 560 aa  154  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1549  signal transduction histidine kinase, LytS  28.82 
 
 		 560 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4007  sensor histidine kinase  28.53 
 
 		 565 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  28.88 
 
 		 565 aa  151  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 559 aa  150  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 559 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 559 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 559 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  29.49 
 
 		 559 aa  150  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  29.49 
 
 		 565 aa  150  4e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  29.49 
 
 		 565 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 564 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>