More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2036 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 371 aa  729    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.069158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1150  histidine kinase internal region  56.32 
 
 		 367 aa  335  7e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1070  histidine kinase internal region  56.32 
 
 		 368 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.480376  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3612  signal transduction histidine kinase, LytS  53.35 
 
 		 355 aa  303  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2263  signal transduction histidine kinase, LytS  55.04 
 
 		 369 aa  299  4e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0157274  normal  0.0685105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  51.88 
 
 		 363 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  38.18 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  37.15 
 
 		 390 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.18 
 
 		 414 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  34.23 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0196  histidine kinase  44.58 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.918677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0472  histidine kinase  44.58 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1103  histidine kinase  44.58 
 
 		 339 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0280712  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1228  histidine kinase  44.58 
 
 		 449 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544927  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  36.65 
 
 		 367 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  44.17 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1457  putative sensor histidine kinase  44.17 
 
 		 336 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821442  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 422 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  42.98 
 
 		 360 aa  160  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  30.25 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  27.59 
 
 		 342 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0420  signal transduction histidine kinase, LytS  41.51 
 
 		 419 aa  143  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211986 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  32.05 
 
 		 359 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 446 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6685  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.15 
 
 		 357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 		 831 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  35.92 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2602  histidine kinase  44.89 
 
 		 173 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0230  two-component system sensor ATPase  38.76 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.779882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 		 578 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 388 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  32.1 
 
 		 362 aa  116  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  28.53 
 
 		 491 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.26 
 
 		 568 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  36.02 
 
 		 369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 565 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 552 aa  110  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  36.18 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1585  signal transduction histidine kinase, LytS  32.29 
 
 		 574 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  35.78 
 
 		 455 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  33.66 
 
 		 357 aa  106  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 		 580 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  27.63 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  36.2 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  31.61 
 
 		 345 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  38.97 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  38.24 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  35.24 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  34.82 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  34.4 
 
 		 362 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  34.01 
 
 		 343 aa  103  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1084  histidine kinase internal region  32.11 
 
 		 575 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0370265  normal  0.975996 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 559 aa  103  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  30.16 
 
 		 565 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 565 aa  102  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  30.16 
 
 		 565 aa  102  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 559 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  30.74 
 
 		 581 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 559 aa  102  9e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 572 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 559 aa  102  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 572 aa  102  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  30.16 
 
 		 559 aa  102  9e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  30.16 
 
 		 559 aa  102  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  24.27 
 
 		 350 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0278  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.98 
 
 		 360 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69480  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  32.46 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0945  histidine kinase  32.39 
 
 		 600 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 568 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  35.47 
 
 		 366 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  35.19 
 
 		 642 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  31.4 
 
 		 565 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  33.63 
 
 		 394 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6008  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  32.46 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.290257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  32.83 
 
 		 556 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  30 
 
 		 582 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0064  histidine kinase internal region  34.45 
 
 		 360 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  28.64 
 
 		 482 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  33.03 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00390  putative regulator of cell autolysis  32.31 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.848872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0848  histidine kinase internal region  31.96 
 
 		 326 aa  100  6e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.751522  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5951  signal transduction histidine kinase, LytS  31.56 
 
 		 975 aa  99.8  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.580279  normal  0.0504112 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  32.11 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  34.35 
 
 		 572 aa  99.8  7e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.2 
 
 		 566 aa  99.8  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 563 aa  99.4  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  32.69 
 
 		 586 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0126  alginate biosynthesis protein AlgZ/FimS  33.97 
 
 		 360 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  98.6  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 557 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  30.04 
 
 		 428 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  31.8 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0251  5TM Receptors of the LytS-YhcK type transmembrane region  31.33 
 
 		 584 aa  98.6  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>