More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3292 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 388 aa  803    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  33.99 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  39.05 
 
 		 366 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  34.68 
 
 		 393 aa  180  4e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.78 
 
 		 389 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  37.14 
 
 		 381 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 		 384 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  41.13 
 
 		 465 aa  156  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  40 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  37.72 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.23 
 
 		 414 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 361 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  35.48 
 
 		 446 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  35.68 
 
 		 607 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  34.07 
 
 		 420 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  37.26 
 
 		 410 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  36.73 
 
 		 390 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  37.56 
 
 		 482 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  36.21 
 
 		 394 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  35.41 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  41.75 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  30.94 
 
 		 491 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  33.88 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  34.43 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  40 
 
 		 576 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  35.09 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  41.78 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 422 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  37.62 
 
 		 342 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  34.93 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  34.74 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.72 
 
 		 572 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  36.4 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  38.92 
 
 		 580 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  35.12 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 		 412 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 357 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  36.92 
 
 		 576 aa  135  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  36.67 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  36.67 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  36.67 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  36.67 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  36.67 
 
 		 559 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  36.67 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  36.67 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  38.1 
 
 		 541 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  36.67 
 
 		 557 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  36.67 
 
 		 565 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 411 aa  133  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 557 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 557 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3263  histidine kinase internal region  31.95 
 
 		 397 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1401  histidine kinase  37.5 
 
 		 360 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  36.23 
 
 		 568 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 403 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  36.19 
 
 		 559 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1178  histidine kinase internal region  34.38 
 
 		 414 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  35.47 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 557 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  38.5 
 
 		 565 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  30.8 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  34.38 
 
 		 380 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 		 398 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  35.96 
 
 		 561 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  35.85 
 
 		 645 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  36.14 
 
 		 400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  39.32 
 
 		 642 aa  130  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  36.15 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  37.5 
 
 		 557 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  34.63 
 
 		 394 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  33.76 
 
 		 603 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  33.77 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  34.69 
 
 		 561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  34.39 
 
 		 428 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  37.73 
 
 		 586 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  35.68 
 
 		 426 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  34.69 
 
 		 561 aa  127  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  34.18 
 
 		 561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 578 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  32.19 
 
 		 414 aa  126  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  35.47 
 
 		 560 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  37.26 
 
 		 831 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  34.84 
 
 		 569 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1966  sensor histidine kinase  35.22 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  36.63 
 
 		 379 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1372  putative sensor histidine kinase  39.17 
 
 		 336 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>