More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2185 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 831 aa  1637    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  35.6 
 
 		 578 aa  155  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  36.19 
 
 		 576 aa  153  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  38.15 
 
 		 576 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  33.9 
 
 		 465 aa  147  6e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 		 446 aa  146  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  34.77 
 
 		 568 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  39.47 
 
 		 455 aa  143  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  36.69 
 
 		 580 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  45.67 
 
 		 450 aa  141  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  37.32 
 
 		 394 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  35.71 
 
 		 558 aa  139  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  35.61 
 
 		 433 aa  137  6.0000000000000005e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  37.25 
 
 		 410 aa  137  8e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  37.75 
 
 		 410 aa  137  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  36.46 
 
 		 564 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  43.35 
 
 		 426 aa  137  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  31.95 
 
 		 558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  36.79 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2506  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.454206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2394  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.764867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1282  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 569 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0211527 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2398  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.79648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2349  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.896071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2305  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  135  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02055  predicted sensory kinase in two-component system with YehT  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1532  signal transduction histidine kinase, LytS  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.363202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0918  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1521  signal transduction histidine kinase, LytS  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2260  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2414  sensor histidine kinase  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02013  hypothetical protein  37.17 
 
 		 561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 		 446 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1441  signal transduction histidine kinase, LytS  37.97 
 
 		 559 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  32.13 
 
 		 568 aa  133  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  35.39 
 
 		 491 aa  132  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3113  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 561 aa  132  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.212432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  39.15 
 
 		 403 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  39.42 
 
 		 405 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 654 aa  131  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0866  sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 561 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  32.99 
 
 		 428 aa  130  8.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  39.42 
 
 		 393 aa  130  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2094  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase internal region:5TM Receptors of the LytS-YhcK type, transmembrane region  35.97 
 
 		 577 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  34.27 
 
 		 556 aa  130  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  34.46 
 
 		 556 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0958  signal transduction histidine kinase, LytS  35.69 
 
 		 563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2684  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 565 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.287497  hitchhiker  0.00116896 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1696  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 565 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0311025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1659  signal transduction histidine kinase, LytS  32.97 
 
 		 565 aa  128  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000213246  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  35.19 
 
 		 391 aa  128  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 557 aa  128  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  34.74 
 
 		 482 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  28.27 
 
 		 603 aa  127  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  37.33 
 
 		 367 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  32.62 
 
 		 582 aa  127  9e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  35.98 
 
 		 567 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  33.83 
 
 		 556 aa  126  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1674  signal transduction histidine kinase, LytS  35.61 
 
 		 565 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0178726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  35.69 
 
 		 394 aa  126  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  35.77 
 
 		 576 aa  126  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  39.11 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  34.94 
 
 		 572 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  36.81 
 
 		 400 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2431  signal transduction histidine kinase, LytS  34.57 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000324417  normal  0.0100076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2501  signal transduction histidine kinase, LytS  34.57 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.443565  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2593  signal transduction histidine kinase, LytS  34.17 
 
 		 560 aa  126  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0091271  hitchhiker  0.0052142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  35.07 
 
 		 572 aa  125  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  36.64 
 
 		 390 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 403 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 403 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 403 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  38.2 
 
 		 361 aa  125  4e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 557 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 388 aa  125  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  32.34 
 
 		 572 aa  124  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  33.83 
 
 		 561 aa  124  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 557 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  34.67 
 
 		 345 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  31.29 
 
 		 581 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.79 
 
 		 557 aa  125  5e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  32.35 
 
 		 581 aa  124  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 384 aa  124  6e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2822  sensor histidine kinase  29.79 
 
 		 560 aa  124  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  32.69 
 
 		 398 aa  124  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  47.48 
 
 		 374 aa  124  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 645 aa  124  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0956  signal transduction histidine kinase, LytS  34.55 
 
 		 563 aa  124  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324121  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  32.96 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  36.8 
 
 		 561 aa  123  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  33.21 
 
 		 522 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  34.72 
 
 		 374 aa  124  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 346 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  36.3 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  28.24 
 
 		 558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  32.96 
 
 		 589 aa  123  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  32.96 
 
 		 589 aa  122  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>