More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5141 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 367 aa  752    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  60 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  37.08 
 
 		 346 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 377 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  28.77 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  26.83 
 
 		 726 aa  143  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3719  sensor histidine kinase  29.3 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  38.69 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.64 
 
 		 358 aa  140  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 357 aa  139  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 374 aa  136  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  39.18 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 394 aa  133  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  31.51 
 
 		 362 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  37.06 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.84 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  34.9 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 389 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  37.06 
 
 		 556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  36.49 
 
 		 369 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  34.47 
 
 		 831 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  31.2 
 
 		 390 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  31.27 
 
 		 586 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  31.74 
 
 		 587 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  29.38 
 
 		 379 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.53 
 
 		 556 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  34.22 
 
 		 491 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  32.84 
 
 		 558 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  33.33 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  31.86 
 
 		 393 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  37.06 
 
 		 353 aa  115  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  26.65 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5735  signal transduction histidine kinase, LytS  27.74 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  39.23 
 
 		 1016 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  31.58 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  33.7 
 
 		 557 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  38.22 
 
 		 645 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 557 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  34.97 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 		 557 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  29.2 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  31.91 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  29.79 
 
 		 342 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1480  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 557 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.336148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  32.51 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  31.05 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2283  signal transduction histidine kinase, LytS  34.48 
 
 		 363 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.25 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  33.01 
 
 		 482 aa  110  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 390 aa  110  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  36.98 
 
 		 359 aa  110  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 		 541 aa  109  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 422 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 408 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  27.95 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  35.48 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 		 393 aa  109  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  34.56 
 
 		 567 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  34.03 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  33.96 
 
 		 642 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2453  histidine kinase internal protein  31.25 
 
 		 568 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.278514  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  32.85 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 568 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03032  histidine kinase family  31.98 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  36.08 
 
 		 558 aa  108  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  35.33 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0722  signal transduction histidine kinase, LytS  31.47 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  29.44 
 
 		 352 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  30.08 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 398 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3090  histidine kinase internal region  36.36 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 366 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  30.57 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3306  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 483 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2024  sensor histidine kinase LytS  37.76 
 
 		 591 aa  107  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 400 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  31.68 
 
 		 565 aa  106  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  30.28 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  31.39 
 
 		 566 aa  106  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1319  membrane receptor, histidine kinase  35.9 
 
 		 560 aa  106  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  33.63 
 
 		 410 aa  106  8e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0934  histidine kinase internal region  27.62 
 
 		 336 aa  105  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  32.5 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>