More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5361 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 357 aa  725    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  55.66 
 
 		 344 aa  350  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  36.64 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  32.15 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  36.36 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  41.07 
 
 		 418 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  32.43 
 
 		 356 aa  181  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  37.76 
 
 		 348 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  33.89 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  38.81 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  34.72 
 
 		 518 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  34.52 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  34.8 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  32.48 
 
 		 352 aa  169  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  41.82 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  41.1 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  36.13 
 
 		 364 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  30.63 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  33.22 
 
 		 355 aa  155  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.75 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  41.58 
 
 		 354 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  31.54 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  30.52 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  31.97 
 
 		 356 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  31.07 
 
 		 356 aa  153  5e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  32.66 
 
 		 350 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  30.7 
 
 		 371 aa  149  9e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  32.93 
 
 		 364 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 501 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  27.64 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  36.67 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  32.74 
 
 		 353 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  28.74 
 
 		 343 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  28.87 
 
 		 368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  37.75 
 
 		 504 aa  133  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  35.44 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  37.19 
 
 		 362 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  37.88 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  28.18 
 
 		 359 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30.63 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  31.58 
 
 		 340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 346 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.47 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  30.27 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  33.85 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  34.41 
 
 		 332 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  26.67 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  35.86 
 
 		 345 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  34.98 
 
 		 469 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  29.25 
 
 		 572 aa  102  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  29.25 
 
 		 572 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  28.04 
 
 		 350 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  32 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  28.21 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  26.88 
 
 		 361 aa  100  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  29.21 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 446 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  29.9 
 
 		 491 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  30.43 
 
 		 561 aa  99  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  27.6 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  28 
 
 		 342 aa  97.4  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  30.67 
 
 		 324 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  27.96 
 
 		 362 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  30.58 
 
 		 726 aa  95.9  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 388 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  29.83 
 
 		 556 aa  95.9  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  29.89 
 
 		 357 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  30.39 
 
 		 556 aa  94.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  30.54 
 
 		 645 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  27.69 
 
 		 654 aa  94  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.15 
 
 		 369 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2453  histidine kinase  29.3 
 
 		 612 aa  93.2  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000429093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  26.77 
 
 		 380 aa  93.2  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  28.63 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  29.67 
 
 		 367 aa  93.2  6e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.36 
 
 		 576 aa  93.2  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  28.43 
 
 		 374 aa  92.4  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0276  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 561 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  29.35 
 
 		 1016 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  31.39 
 
 		 375 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  26.88 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.11 
 
 		 370 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  29.51 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0225  hypothetical protein  27.19 
 
 		 558 aa  91.7  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  28.7 
 
 		 377 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  31.55 
 
 		 445 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>