More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2164 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 346 aa  701    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  31.83 
 
 		 348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  30.33 
 
 		 387 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  28.66 
 
 		 344 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  40.1 
 
 		 413 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  32.59 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  35.86 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  32.21 
 
 		 390 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  29.36 
 
 		 352 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  34.04 
 
 		 395 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  30.6 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 		 369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  35.05 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  32 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  32.52 
 
 		 518 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  36.13 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 381 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  34.34 
 
 		 394 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  37.77 
 
 		 469 aa  110  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  30.74 
 
 		 352 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  33.95 
 
 		 343 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  27.81 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  34.83 
 
 		 362 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  34.02 
 
 		 351 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 360 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  32.64 
 
 		 356 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  33.49 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  28.99 
 
 		 352 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  30.35 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  27.62 
 
 		 353 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 358 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  32.14 
 
 		 356 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  27.66 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  30.74 
 
 		 350 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  31.5 
 
 		 504 aa  97.1  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 374 aa  96.3  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  32.46 
 
 		 355 aa  96.3  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  25.23 
 
 		 368 aa  95.9  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  25.85 
 
 		 340 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  31.64 
 
 		 332 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 369 aa  95.1  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  27.95 
 
 		 364 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  28.37 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  27.65 
 
 		 501 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 344 aa  93.2  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  27.27 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  30.16 
 
 		 371 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.59 
 
 		 578 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  31.22 
 
 		 350 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  29.02 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  26.19 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  25.86 
 
 		 359 aa  90.5  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  27.74 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  28.77 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  26.61 
 
 		 303 aa  90.1  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 338 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  31.82 
 
 		 399 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 357 aa  89.4  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  27.37 
 
 		 356 aa  89.4  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  27.91 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  31 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  29.19 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  26.52 
 
 		 408 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  29.36 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1005  signal transduction histidine kinase, LytS  28.32 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000807756  normal  0.310499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4496  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 586 aa  86.7  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  27.1 
 
 		 357 aa  86.7  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3727  signal transduction histidine kinase, LytS  31.77 
 
 		 342 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1959  histidine kinase  32.06 
 
 		 414 aa  85.9  9e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  31.12 
 
 		 377 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.28 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  25.35 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  23.44 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  27.49 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.42 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2353  signal transduction histidine kinase, LytS  32.3 
 
 		 1021 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3406  histidine kinase internal region  25.56 
 
 		 603 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.264135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  28.51 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1316  signal transduction histidine kinase, LytS  28.97 
 
 		 372 aa  82.4  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  31.77 
 
 		 362 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2790  histidine kinase internal region  28.32 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0103  signal transduction histidine kinase, LytS  32.04 
 
 		 495 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  29.02 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  26.45 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4868  signal transduction histidine kinase, LytS  33.51 
 
 		 340 aa  81.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  23.2 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  28.9 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.26 
 
 		 576 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  25 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  23.58 
 
 		 831 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2433  signal transduction histidine kinase, LytS  26.96 
 
 		 558 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.618184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  27.23 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>