More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0422 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 340 aa  685    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  37.42 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  40.36 
 
 		 364 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  34.68 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  36.73 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  36.55 
 
 		 501 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  35.61 
 
 		 369 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  39.27 
 
 		 395 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  28.1 
 
 		 344 aa  132  6.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 407 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  33.86 
 
 		 518 aa  126  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  27.42 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  26.92 
 
 		 357 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  30.18 
 
 		 351 aa  123  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  32.9 
 
 		 353 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  33.63 
 
 		 344 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  32.57 
 
 		 356 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  32.92 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  37.37 
 
 		 394 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  32.7 
 
 		 352 aa  118  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 413 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  30.6 
 
 		 368 aa  116  6e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  32.2 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  27.44 
 
 		 347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  31.03 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  29.77 
 
 		 348 aa  113  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  31.7 
 
 		 360 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  32.72 
 
 		 355 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  30.45 
 
 		 364 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  33.08 
 
 		 345 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  28.02 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  27.78 
 
 		 349 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  33.65 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  30.29 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  27.6 
 
 		 348 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  26.74 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  30.22 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  33.91 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  30.93 
 
 		 355 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  32.99 
 
 		 350 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 354 aa  102  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  32.71 
 
 		 343 aa  102  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.37 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  29.06 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  27.13 
 
 		 352 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  30.88 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 346 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  32.38 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  33.96 
 
 		 377 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 		 558 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 370 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  24.15 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1017  sensor histidine kinase, putative  30.29 
 
 		 579 aa  95.1  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  32.32 
 
 		 403 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  26.76 
 
 		 356 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  28.96 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 388 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  24.52 
 
 		 350 aa  93.6  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 591 aa  93.2  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  28.99 
 
 		 379 aa  92.8  7e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  29.82 
 
 		 390 aa  92  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  32.87 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  31.19 
 
 		 333 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  27.3 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  28.57 
 
 		 340 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  29.46 
 
 		 381 aa  90.9  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  28.88 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6581  signal transduction histidine kinase, LytS  27.69 
 
 		 541 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  27.19 
 
 		 342 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  28.92 
 
 		 360 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  30.93 
 
 		 350 aa  89.7  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  27.27 
 
 		 374 aa  89.7  7e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  30.42 
 
 		 362 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  32.37 
 
 		 831 aa  89.4  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  24.9 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  28.97 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  29.95 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  30 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 589 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  29.03 
 
 		 589 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 589 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 589 aa  86.3  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 589 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 589 aa  86.3  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 589 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 589 aa  86.3  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5574  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  28.04 
 
 		 393 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  29.9 
 
 		 576 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  29.65 
 
 		 522 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1324  signal transduction histidine kinase, LytS  29.79 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0634382  hitchhiker  0.00226936 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  22.32 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2114  putative sensor with HAMP domain  27.27 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.28006  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  28.57 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0495  histidine kinase internal region  27.51 
 
 		 604 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>