More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2031 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  100 
 
 		 352 aa  710    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  39.05 
 
 		 350 aa  241  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  33.14 
 
 		 365 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  33.33 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  33.62 
 
 		 352 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  32.02 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  31.53 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  32.01 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 369 aa  156  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  35.32 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 395 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  31.67 
 
 		 375 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  32.91 
 
 		 518 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 360 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  26.79 
 
 		 348 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  38.61 
 
 		 394 aa  143  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  28.9 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  38.28 
 
 		 407 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  27.68 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  39.23 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  34.89 
 
 		 364 aa  139  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  35.14 
 
 		 418 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  29.93 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  38.36 
 
 		 348 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  33.88 
 
 		 343 aa  135  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  29.39 
 
 		 364 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  34.89 
 
 		 501 aa  133  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  28.28 
 
 		 371 aa  131  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  27.73 
 
 		 356 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  37.17 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  40.84 
 
 		 350 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  39.17 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  31.95 
 
 		 368 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  27.86 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  27.97 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  29.36 
 
 		 346 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  33.04 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  28.1 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  31.75 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  34.44 
 
 		 362 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  27.89 
 
 		 359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  27.72 
 
 		 390 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  32.73 
 
 		 504 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  34.62 
 
 		 349 aa  116  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  30.46 
 
 		 389 aa  113  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  30.05 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  29.78 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  35.75 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  30 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.95 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  32.98 
 
 		 358 aa  106  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  30.05 
 
 		 726 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  31.51 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  29.59 
 
 		 393 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  31.25 
 
 		 377 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  24.79 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  30.41 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  31.41 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  32.84 
 
 		 380 aa  100  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  27.9 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  26.38 
 
 		 491 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  31.02 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5317  histidine kinase internal region  30.61 
 
 		 364 aa  99.4  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.500348  normal  0.455673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 345 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  31.16 
 
 		 340 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  29.26 
 
 		 357 aa  99  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  26.44 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  25.44 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  29.28 
 
 		 831 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4385  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 482 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  28.18 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3680  histidine kinase internal region  28.57 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1362  histidine kinase internal region  27.49 
 
 		 366 aa  96.3  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 344 aa  95.9  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  28.77 
 
 		 426 aa  96.3  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  26.64 
 
 		 381 aa  95.9  9e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  31.28 
 
 		 578 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 362 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.53 
 
 		 369 aa  95.1  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  27.27 
 
 		 642 aa  94.7  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  29.77 
 
 		 645 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 357 aa  94  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  28.72 
 
 		 377 aa  93.2  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  27.4 
 
 		 340 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  25.42 
 
 		 346 aa  92.8  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  26.33 
 
 		 367 aa  92.4  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  27 
 
 		 374 aa  92.8  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  23.64 
 
 		 366 aa  92.8  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2665  histidine kinase internal region  31.74 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4847  signal transduction histidine kinase, LytS  29.84 
 
 		 382 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.716218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  26.16 
 
 		 400 aa  92  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 388 aa  92.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3313  histidine kinase internal region  31.74 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.569837  normal  0.103131 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  25.6 
 
 		 367 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3671  histidine kinase internal region  29.63 
 
 		 352 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>