More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0494 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 645 aa  1315    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4305  signal transduction histidine kinase, LytS  34.97 
 
 		 654 aa  365  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.119677  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 1016 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2452  signal transduction histidine kinase, LytS  38.03 
 
 		 408 aa  180  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00298598  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  42.86 
 
 		 1018 aa  179  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  37.61 
 
 		 568 aa  168  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2355  signal transduction histidine kinase, LytS  41.67 
 
 		 580 aa  167  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.461368  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6326  signal transduction histidine kinase, LytS  40.47 
 
 		 398 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.521722 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2761  signal transduction histidine kinase, LytS  36.74 
 
 		 394 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4050  signal transduction histidine kinase, LytS  38.18 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4125  signal transduction histidine kinase, LytS  38.18 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal  0.628392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4559  signal transduction histidine kinase, LytS  38.18 
 
 		 409 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.646655 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4279  signal transduction histidine kinase, LytS  38.18 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0700  histidine kinase internal region  37.73 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2698  histidine kinase internal region  38.64 
 
 		 576 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0468  signal transduction histidine kinase, LytS  38.97 
 
 		 450 aa  154  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1762  signal transduction histidine kinase, LytS  37.74 
 
 		 465 aa  153  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.513767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2958  signal transduction histidine kinase, LytS  40.8 
 
 		 568 aa  152  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.177996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3543  signal transduction histidine kinase, LytS  32.96 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00838652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5007  signal transduction histidine kinase, LytS  38.91 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131071  decreased coverage  0.00000540633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5281  signal transduction histidine kinase, LytS  38.68 
 
 		 391 aa  152  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119621  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2144  signal transduction histidine kinase, LytS  37.73 
 
 		 408 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0137321  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0358  histidine kinase internal region  38.39 
 
 		 374 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1152  signal transduction histidine kinase, LytS  38.86 
 
 		 394 aa  150  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1376  signal transduction histidine kinase, LytS  39.34 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  38.12 
 
 		 581 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4493  histidine kinase internal region  38.01 
 
 		 408 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555212  normal  0.320157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02290  predicted sensory kinase in two-component system with YpdB  38.46 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1277  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2749  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1289  signal transduction histidine kinase, LytS  38.46 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02251  hypothetical protein  38.46 
 
 		 565 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3404  signal transduction histidine kinase, LytS  37.88 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.823402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2517  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2670  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2532  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3612  sensor histidine kinase  38.46 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.857731 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1394  signal transduction histidine kinase, LytS  37.91 
 
 		 393 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000264266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2857  ATP-binding region, ATPase-like  38.1 
 
 		 363 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1225  signal transduction histidine kinase, LytS  34.91 
 
 		 603 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.247489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2134  signal transduction histidine kinase LytS  36.74 
 
 		 394 aa  147  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.775402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1878  signal transduction histidine kinase, LytS  36.74 
 
 		 581 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.770711  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3173  signal transduction histidine kinase, LytS  36.82 
 
 		 411 aa  146  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0466454  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0899  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 572 aa  146  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144133  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  36.95 
 
 		 557 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1329  signal transduction histidine kinase LytS  36.62 
 
 		 432 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268235  normal  0.0194209 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 557 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 557 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  38.69 
 
 		 565 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 557 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 557 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  36.45 
 
 		 557 aa  144  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3378  signal transduction histidine kinase, LytS  38.5 
 
 		 394 aa  143  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1339  signal transduction histidine kinase, LytS  33.64 
 
 		 426 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  36.63 
 
 		 566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0064  signal transduction histidine kinase, LytS  38.71 
 
 		 428 aa  140  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00850  putative regulator of cell autolysis  36.28 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.432322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  38.02 
 
 		 566 aa  139  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4128  signal transduction histidine kinase, LytS  38.89 
 
 		 338 aa  139  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1965  histidine kinase internal region  34.43 
 
 		 576 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  40.58 
 
 		 582 aa  137  5e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12150  putative regulator of cell autolysis  38.62 
 
 		 325 aa  137  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0160  ATP-binding region, ATPase-like  37.38 
 
 		 567 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0069  signal transduction histidine kinase, LytS  36.28 
 
 		 400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0746502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  26.9 
 
 		 1022 aa  134  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  35.12 
 
 		 346 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 502 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  35.15 
 
 		 374 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3774  signal transduction histidine kinase, LytS  36.18 
 
 		 446 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.469079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2056  putative sensor with HAMP domain  38.07 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2171  ATP-binding region, ATPase-like  35.16 
 
 		 455 aa  130  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346246  normal  0.0306612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 388 aa  130  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00985  hypothetical protein  35.82 
 
 		 556 aa  130  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  39.11 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5235  signal transduction histidine kinase, LytS  34.08 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1766  signal transduction histidine kinase, LytS  36.32 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.420125  hitchhiker  0.00747728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4381  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 377 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  32.56 
 
 		 578 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2792  signal transduction histidine kinase, LytS  37.32 
 
 		 564 aa  127  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000275265  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0377  Signal transduction histidine kinase (STHK), LytS  34.33 
 
 		 576 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5566  sensor histidine kinase LytS  33.18 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5537  sensor histidine kinase LytS  33.18 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5296  sensor histidine kinase LytS  33.18 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5123  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5138  sensor histidine kinase  33.18 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5692  sensor histidine kinase LytS  33.18 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  36.44 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  27.43 
 
 		 708 aa  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 641 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2882  signal transduction histidine kinase, LytS  34.8 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0010106  unclonable  0.0000000000662994 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004413  autolysin sensor kinase  36.14 
 
 		 556 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 357 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3248  putative sensor with HAMP domain  33.02 
 
 		 600 aa  125  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5383  sensor histidine kinase LytS  33.18 
 
 		 522 aa  125  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.498572  normal  0.326696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3959  signal transduction histidine kinase, LytS  34.51 
 
 		 591 aa  124  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3342  signal transduction histidine kinase, LytS  36.5 
 
 		 556 aa  124  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.891854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2185  signal transduction histidine kinase, LytS  37.67 
 
 		 831 aa  124  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5622  sensor histidine kinase LytS  32.71 
 
 		 589 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  35.03 
 
 		 342 aa  124  7e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>