More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3279 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 356 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  49.71 
 
 		 364 aa  333  2e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  50.71 
 
 		 355 aa  321  9.999999999999999e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  45.45 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  43.39 
 
 		 360 aa  262  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  43.15 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  34.16 
 
 		 352 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  33.89 
 
 		 331 aa  173  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  30.15 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  32.01 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 349 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  32.89 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  31.97 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  42.11 
 
 		 387 aa  152  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  33.73 
 
 		 364 aa  152  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  36.12 
 
 		 518 aa  149  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  40.38 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  40.89 
 
 		 407 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  32.4 
 
 		 371 aa  146  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  37.75 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  36.09 
 
 		 501 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  31.14 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  28.9 
 
 		 352 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  30.81 
 
 		 350 aa  143  5e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  29.52 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  38.43 
 
 		 348 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  31.17 
 
 		 344 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  38.58 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  34.86 
 
 		 348 aa  135  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  36.82 
 
 		 504 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  28.71 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  29.6 
 
 		 365 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  30.86 
 
 		 351 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  38.24 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  34.33 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  29.43 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  34.07 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  35.06 
 
 		 343 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  28.72 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  28.12 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  28.84 
 
 		 359 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  34.21 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  29.13 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789837  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  27.81 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07025  histidine kinase  29.13 
 
 		 340 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  24.92 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  31.39 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  37.02 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1289  histidine kinase  28.09 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.847717  normal  0.228137 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  32.98 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  34.36 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  31.34 
 
 		 389 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  35.51 
 
 		 469 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 356 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1351  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.13 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  31.53 
 
 		 367 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2328  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 565 aa  102  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0659282  normal  0.34431 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  35.35 
 
 		 342 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  34 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 446 aa  99.4  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  32.49 
 
 		 362 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  33.18 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  33.98 
 
 		 726 aa  98.6  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  32.67 
 
 		 346 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 557 aa  97.4  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2170  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 581 aa  97.1  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.041747  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0058  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 557 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0059  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 557 aa  96.7  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.996795  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2114  histidine kinase  30.69 
 
 		 607 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.156393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0032  sensory transduction protein kinase AlgZ  30.63 
 
 		 364 aa  96.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4300  signal transduction histidine kinase, LytS  29.91 
 
 		 557 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0131803  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 357 aa  96.3  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 357 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  31.34 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2358  signal transduction histidine kinase, LytS  30.97 
 
 		 566 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 399 aa  94.7  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  33.5 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  30.85 
 
 		 370 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  33.67 
 
 		 377 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0056  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 557 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0698199  decreased coverage  0.000000126428 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0054  signal transduction histidine kinase, LytS  30.26 
 
 		 557 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0736236  hitchhiker  0.000664675 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2444  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 566 aa  94  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.221441  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10410  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 578 aa  94  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014237  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1380  histidine kinase internal region  33.11 
 
 		 390 aa  93.6  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  30.56 
 
 		 374 aa  93.6  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  31.98 
 
 		 491 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  28.31 
 
 		 349 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  24.25 
 
 		 382 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.44 
 
 		 369 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2398  signal transduction histidine kinase, LytS  30.23 
 
 		 568 aa  92.4  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0189  histidine kinase internal region  31.07 
 
 		 642 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  33.02 
 
 		 362 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2919  signal transduction histidine kinase, LytS  30.84 
 
 		 565 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.125544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>