More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1681 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 369 aa  746    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  32.59 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  34.8 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  34.1 
 
 		 395 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  34.76 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  38.43 
 
 		 418 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  32.4 
 
 		 413 aa  160  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  30.11 
 
 		 518 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  44.5 
 
 		 348 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  35.03 
 
 		 352 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  30.93 
 
 		 360 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  30.85 
 
 		 352 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  39.73 
 
 		 354 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  31.38 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  41.26 
 
 		 504 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  31.74 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  38.03 
 
 		 387 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  30.91 
 
 		 356 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  29.97 
 
 		 364 aa  149  8e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  29.14 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  28.69 
 
 		 356 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  29.61 
 
 		 375 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  36.48 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  31.59 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  35.61 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  29.25 
 
 		 331 aa  140  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  38.01 
 
 		 347 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  38.78 
 
 		 501 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  35.66 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  31.63 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  34.25 
 
 		 348 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 381 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  30.26 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 350 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  40.34 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 353 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  37.19 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  38.02 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  35.96 
 
 		 349 aa  121  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  32.8 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  27.47 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  38.18 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  34.04 
 
 		 390 aa  113  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 394 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  35.08 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  29.62 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  26.47 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  27.25 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6587  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 352 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.423236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  32.99 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  30.41 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  25.51 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  29.21 
 
 		 389 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  34 
 
 		 324 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2442  signal transduction histidine kinase, LytS  27.47 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  31.82 
 
 		 469 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  30.69 
 
 		 345 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  29.73 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  29.41 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1541  histidine kinase internal region  32.98 
 
 		 303 aa  92  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.441637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 357 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.57 
 
 		 346 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0494  signal transduction histidine kinase, LytS  29.29 
 
 		 645 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000248497  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3160  histidine kinase internal region  29.06 
 
 		 350 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  27.14 
 
 		 393 aa  89  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3732  putative regulator of cell autolysis-like  30.05 
 
 		 726 aa  88.6  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.55783  normal  0.877346 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3292  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  32.82 
 
 		 377 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  31.12 
 
 		 360 aa  86.7  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  34.71 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6677  signal transduction histidine kinase, LytS  29.96 
 
 		 344 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 362 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  29.44 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0115  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 552 aa  86.3  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.368367  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0228  histidine kinase internal region  30.45 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0985365  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  29.53 
 
 		 369 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3912  signal transduction histidine kinase, LytS  27.5 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  29.57 
 
 		 374 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3593  signal transduction histidine kinase, LytS  29.32 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0532594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000975  autolysin sensor kinase  28.25 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.948194  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  27.05 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  28.06 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3837  periplasmic senrsor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0222  signal transduction histidine kinase, LytS  26.87 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  28.24 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  22.83 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0489  histidine kinase internal region  28.57 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  25.42 
 
 		 362 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4236  sensor histidine kinase  28.37 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0764  histidine kinase internal region  29.49 
 
 		 582 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.294756 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4613  putative sensor histidine kinase  28.85 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  26.73 
 
 		 370 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4086  signal transduction histidine kinase, LytS  32.09 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  26.64 
 
 		 340 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  27.32 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0068  signal transduction histidine kinase, LytS  30.32 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.361346  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  26.64 
 
 		 379 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>