More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5135 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5135  signal transduction histidine kinase, LytS  100 
 
 		 381 aa  778    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0422  signal transduction histidine kinase, LytS  36.57 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.910076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0589  histidine kinase internal region  28.04 
 
 		 504 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1843  signal transduction histidine kinase, LytS  40.17 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.81791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7299  signal transduction histidine kinase, LytS  37.9 
 
 		 501 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2241  signal transduction histidine kinase, LytS  40.82 
 
 		 364 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4283  signal transduction histidine kinase, LytS  31.6 
 
 		 349 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.479453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5361  signal transduction histidine kinase, LytS  34.5 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5231  signal transduction histidine kinase, LytS  38.5 
 
 		 518 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0707794  normal  0.0138184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2134  signal transduction histidine kinase, LytS  37.39 
 
 		 387 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1724  signal transduction histidine kinase, LytS  38.74 
 
 		 395 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0216  histidine kinase internal region  31.07 
 
 		 344 aa  139  7.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0825  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1842  histidine kinase internal region  37.69 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000978653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3789  signal transduction histidine kinase, LytS  38.58 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.938742  normal  0.0445947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3279  signal transduction histidine kinase, LytS  29.03 
 
 		 356 aa  133  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0392  signal transduction histidine kinase, LytS  30.19 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4523  signal transduction histidine kinase, LytS  36.68 
 
 		 365 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000285386  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1681  signal transduction histidine kinase, LytS  34.29 
 
 		 369 aa  133  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4133  signal transduction histidine kinase, LytS  33.33 
 
 		 347 aa  132  7.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.500878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0331  signal transduction histidine kinase, LytS  34.98 
 
 		 355 aa  132  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.678845  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5299  signal transduction histidine kinase, LytS  39.5 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.998299  normal  0.0575383 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5382  signal transduction histidine kinase, LytS  32.02 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0598  signal transduction histidine kinase, LytS  32.31 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.088146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3125  histidine kinase internal region  34.5 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3174  hypothetical protein  35.91 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1178  signal transduction histidine kinase, LytS  35.2 
 
 		 413 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0763  signal transduction histidine kinase, LytS  35.71 
 
 		 343 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692983 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3627  signal transduction histidine kinase, LytS  35.5 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0222112 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0992  signal transduction histidine kinase, LytS  27.76 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3969  signal transduction histidine kinase, LytS  30.9 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.260547  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2576  two-component sensor histidine kinase  29.41 
 
 		 349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5302  signal transduction histidine kinase, LytS  29.04 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0734  signal transduction histidine kinase, LytS  30.77 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2790  signal transduction histidine kinase, LytS  30.55 
 
 		 368 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.111676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4711  signal transduction histidine kinase, LytS  34.87 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2061  signal transduction histidine kinase, LytS  33.16 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2031  histidine kinase internal region  30.05 
 
 		 352 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0905  signal transduction histidine kinase, LytS  33.19 
 
 		 355 aa  113  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383692  normal  0.314637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3925  signal transduction histidine kinase, LytS  34.39 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.684171  normal  0.359117 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2164  signal transduction histidine kinase, LytS  32.86 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.249124  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5597  signal transduction histidine kinase, LytS  32.55 
 
 		 352 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000235776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04905  putative two-component system sensor but no kinase domain  27.36 
 
 		 371 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.339726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0978  signal transduction histidine kinase, LytS  33.87 
 
 		 345 aa  109  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0251166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1646  signal transduction histidine kinase, LytS  33.81 
 
 		 359 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4085  signal transduction histidine kinase, LytS  30.3 
 
 		 375 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0375  signal transduction histidine kinase, LytS  30.4 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3395  signal transduction histidine kinase, LytS  31.31 
 
 		 390 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.703559 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0419  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 394 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.287755  normal  0.0120323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5311  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 342 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5141  signal transduction histidine kinase, LytS  29.29 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2150  signal transduction histidine kinase, LytS  30.13 
 
 		 367 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000713054  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6668  histidine kinase internal region  36.36 
 
 		 469 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1835  signal transduction histidine kinase, LytS  30.73 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1526  signal transduction histidine kinase, LytS  33.18 
 
 		 377 aa  99.4  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2672  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.04 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156498 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6982  signal transduction histidine kinase, LytS  31.43 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.699134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5029  signal transduction histidine kinase, LytS  30.7 
 
 		 328 aa  97.4  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.586514  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2440  histidine kinase internal region  27.07 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3901  putative regulator of cell autolysis-like  27.31 
 
 		 375 aa  96.3  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1861  signal transduction histidine kinase, LytS  32.98 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.923195  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1820  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 361 aa  95.9  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2674  signal transduction histidine kinase, LytS  28.21 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.957681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0616  signal transduction histidine kinase, LytS  28.93 
 
 		 349 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.650329  normal  0.363889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5162  signal transduction histidine kinase, LytS  26.8 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.000379342 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0931  signal transduction histidine kinase, LytS  31.84 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.738687  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2254  histidine kinase internal region  31.17 
 
 		 362 aa  93.6  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2867  signal transduction histidine kinase, LytS  31.78 
 
 		 399 aa  93.6  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11998  hypothetical protein  31.43 
 
 		 454 aa  92.8  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.899904  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0037  histidine kinase internal region  30.54 
 
 		 340 aa  92.8  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0479  signal transduction ATPase  28.65 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4800  signal transduction histidine kinase, LytS  29.28 
 
 		 374 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3938  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 		 572 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2277  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3669  sensory transduction protein kinase AlgZ  33.17 
 
 		 343 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00147493  normal  0.157843 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4137  signal transduction histidine kinase, LytS  31.18 
 
 		 572 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4032  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0162124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3488  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 		 357 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2330  signal transduction histidine kinase, LytS  28.15 
 
 		 362 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0802688  hitchhiker  0.00786489 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1113  signal transduction histidine kinase, LytS  30.66 
 
 		 370 aa  90.1  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3061  histidine kinase internal region  28.19 
 
 		 345 aa  90.1  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.644326  hitchhiker  0.00358726 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0705  signal transduction histidine kinase, LytS  33.68 
 
 		 393 aa  90.1  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.967481  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5404  signal transduction histidine kinase, LytS  33.82 
 
 		 362 aa  89.7  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1315  signal transduction histidine kinase, LytS  32.16 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1150  signal transduction histidine kinase, LytS  24.74 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4563  signal transduction histidine kinase, LytS  22.37 
 
 		 350 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257094  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4913  signal transduction histidine kinase, LytS  27.41 
 
 		 445 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.759043  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2973  signal transduction histidine kinase, LytS  31.88 
 
 		 369 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.341771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1400  signal transduction histidine kinase, LytS  27.49 
 
 		 1051 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3001  DEAD/DEAH box helicase-like  27.11 
 
 		 370 aa  88.6  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271978 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1002  sensor histidine kinase  26.48 
 
 		 410 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2907  signal transduction histidine kinase, LytS  28.97 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4002  signal transduction histidine kinase, LytS  32.18 
 
 		 338 aa  88.6  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2386  signal transduction histidine kinase, LytS  29.24 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1474  signal transduction histidine kinase, LytS  31.31 
 
 		 339 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0623535 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1445  signal transduction histidine kinase, LytS  33.5 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.355242 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1171  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 410 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01917  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 357 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6103  signal transduction histidine kinase, LytS  31.94 
 
 		 362 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0386  hypothetical protein  30.99 
 
 		 359 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>